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病毒分类
Southern rice black-streaked dwarf viruse (SRBSDV)南方水稻黑条矮缩病毒
片段 dsRNA大小/nt G+C/% ORF 蛋白分子质量/kDa 蛋白功能和位置 7 2193 33.9 42~1130 41.2 非结构蛋白,管状结构 1183~2112 36.4 非结构蛋白 8 1927 34.5 25~1800 68.1 内核蛋白(可能NTP结合) 9 1900 34.0 52~1095 39.9 非结构蛋白,病毒基质 1160~1789 24.2 非结构蛋白 10 1801 36.2 22~1698 63.3 主要外层衣壳
表 SRBSDV基因组编码蛋白的功能
Table 1-2 The possible function of protein by coding of SRBSDV
基因组片段 大小(Size /bp) 阅读框(ORFs) 蛋白大小/kDa 预测蛋白功能 S1 4499 36-4430 168.5 RdRp) S2 3816 47-3727 141.3 内壳蛋白(capsid shell protein) S3 3571 15-3455 131.8 加冒酶(capping enzyme) S4 3615 34-3540 135.2 B型刺突(B-spike) S5 3167 16-2835 106.9 未知(nonstructural protein) S6 2650 81-2462 89.6 沉默抑制子(silencing suppressor) S7 2176 41-1114 40.9 小管蛋白(tubule protein) 1166-2095 36.2 未知(nonstructural protein) S8 1928 25-1800 68.0 内壳(core) S9 1899 52-1095 39.9 病毒原质(viroplasm) 1159-1788 24.2 未知(nonstructural protein) S10 1797 22-1695 63.0 外壳蛋白(major outer capsid proteins)
?中文名 学名? 斐济病病毒亚组1 斐济病病毒 Fiji disease virus(FDV) 斐济病病毒亚组2 黑条矮缩病毒 ?Rice black streaked dwarf virus(RBSDV) 米粗缩病毒 ?Maize rough dwarf virus(MRDV) 奥夸尔托病毒 ?Mal de Rio Cuarto virus(MRCV) 唐矮化病毒 ?Pangola stunt virus(PaSV) 南方水稻黑条矮缩病毒 Southern black-streaked dwarf virus(SRBSDV) 斐济病病毒亚组3 燕麦不孕矮缩病毒 Oat sterile dwarf virus(OSDV) 斐济病病毒亚组4 大蒜矮缩病毒 Garlic dwarf virus(OSDV) 斐济病病毒亚组 稻飞虱呼肠孤病毒 Nilaparvata lugens reovirus(NLRV) Table1-1. classification of Fijiviru斐济病病毒水稻矮缩病毒(Akita分离物)的基因组结构:[1]?
片段? dsRNA大小
/nt? 5~3非编码区
/nt? 蛋白名称? 蛋白分子质量?
/kDa ?预测值 /kDa ?功能和位置 ?1 ?4423 ?35~53 P1(Pol)? 164.1? 170? 内核,RNA聚合酶? ?2 ?3512 ?14~147 ?P2 123.0? 130? 外层衣壳? ?3 ?3195 ?38~97 P3? 114.3? ?110 主要内核? ?4 ?2468 ?63~221 Pns4? 79.8? 83? 非结构蛋白? ?5 2570 ?26~138 P5(Cap)? 90.5? 89? 内核,鸟苷酸转移酶? ?6 ?1699 ?48~121 Pns6? 57.4? 56? 非结构蛋白? ?7 ?1696 ?25~150 ?P7 ?55.3 58? 内核,核酸结合蛋白? ?8 ?1427 ?23~138 ?P8(T13) ?46.5 ?43 ?主要外层衣壳 ?9 ?1305 ?24~225 Pns9? 38.9? 49? 非结构蛋白? ?10 ?1321 ?26~233 ?Pns10 39.2? 35? ?非结构蛋白? ?11 ??1067 ?29~492 ??Pns11a ?19.9 ?23
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