代谢组学答案-副本详细分析.docx

一． 名词解释 1. 系统生物学：系统生物学是系统性地研究一个生物系统中所有组成成分（DNA、RNA、蛋白质、代谢物等）的构成以及在特定条件下这些组分间的相互关系，并分析生物系统在一定时间内的动力学过程。 2. 生命系统的涌现性：一个系统自动形成一些新的系统特性，这些特性不能从其组成部分的特性中预测出来 3. 生命系统的稳健性：生物系统的稳健性是指生物系统能够抵抗内部或者外部的干扰，并维持其功能的一种特性。 4. 基因组（Genome），一般的定义是单倍体细胞中的全套染色体为一个基因组，或是单倍体细胞中的全部基因为一个基因组。包括核基因组与非核基因组（如线粒体基因组和叶绿体基因组等）。 5. 转录组（Transcriptome）：广义上指在特定条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。 6. 蛋白质组（Proteome），指在特定条件下一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 7. 代谢组：指一个细胞中参与一般代谢反应和维持生长与正常功能所需要的全部天然小分子 8. 直系同源指的是两个基因通过物种的形成而产生，源于不同物种的最近的共同的一个祖先。 9. 旁系同源是指两个基因在同一个物种中，通过至少一次的基因复制或分歧时间而产生。 10.正向遗传学正向遗传学是指，通过生物个体或细胞的基因组的自发突变或人工诱变，寻找相关的表型或性状改变，然后从这些特定性状变化的个体或细胞中找到对应的突变基因，并揭示其功能。11.反向遗传学反向遗传学是相对于正向（经典）遗传学而提出来的。是在已知基因序列的基础上，利用现代生物理论与技术，通过核苷酸序列的突变、缺失、插入等手段创造突变体并研究突变所造成的表型效应，即反向遗传学是直接从遗传物质入手来研究基因的生物学功能，阐述生物生命发生的本质现象与规律。12.基因捕获基因捕获技术是一种报告基因随机整合技术，通过报告基因与目的基因的融合来检测目的基因的活性。可以根据融合基因在不同时空的表达形态鉴定目的基因的表达模式，?并根据不同条件下的突变表型鉴定基因功能。基因捕获包括3三种形式，即增强子捕获（enhancer?trap）、启动子捕获（promoter?trap）和基因捕获（gene?trap）。 12．基因捕获：基因捕获技术是一种报告基因随机整合技术，通过报告基因与目的基因的融合来检测目的基因的活性。可以根据融合基因在不同时空的表达形态鉴定目的基因的表达模式， 并根据不同条件下的突变表型鉴定基因功能。基因捕获包括3 三种形式，即增强子捕获（enhancer trap）、启动子捕获（promoter trap）和基因捕获（gene trap）。 13．转录因子：通常被定义为蛋白质，结合在DNA的特定序列，能够激活或者抑制转录。大多数已知的转录因子根据其不同的DNA结合域，被划分为以下几组：DNA结合域，蛋白质-蛋白质结合域，转录激活域。 14．miRNA：是一段短的、内生性表达的未转录RNA分子，它由来自较长RNA前体的茎环区域的Dicer-样蛋白调控的。 15. 什么是蛋白激酶？ Protein kinases (PKs) are a major class of signaling molecules that catalyze reversible phosphorylation of a large proportion of cellular proteins (～30%), thereby modulating protein activity and gene expression.蛋白激酶: 蛋白激酶(PKs)是一类信号分子，促进大部分细胞蛋白可逆磷酸化，从而调节蛋白质的活性和基因表达 16蛋白质直系同源簇数据库；是对细菌，藻类和真核生物的21个完整基因组的编码蛋白，根据系统进化关系分类构建而成。COG库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。 17.图位克隆：它是近几年随着各种分子标记图谱的相继建立而发展起来的一种新的基因克隆技术。功能基因在基因组中都有相对稳定的基因座。用与目的基因紧密连锁的分子标记筛选DNA文库，从而构建出目的基因区域的物理图谱，然后通过物理图谱通过染色体步移的方法逐步的逼近目的基因的方法最终克隆目的基因 18. 核开关（Riboswitch)：核开关是位于mRNA非编码区能与细胞代谢产物特异结合而引起构象变化，从而调控基因表达的结构元件。核开关（Riboswich）是最近发现的一种新的基因表达调控机制。它是通过结合小分子代谢物调控基因表达的mRNA元件，位于特定的mRNA区域。核开关可以不依赖于任何蛋白质因子而直接结合小分子的代谢物，从而在转录水平和