chapter4-5nucleicacid,gene,nucleosome,chrosome,genomeandgenomics重点分析.ppt

核小体核心组蛋白尾巴结构域的化学修饰及组蛋白假说 组蛋白分子的球形主体部分无疑是位 于八聚体核心内，但是组蛋白分子携 带着修饰位点的N 端尾巴如何定位尚 不清楚，其位置可能有较大变动。 组蛋白N端乙酰化修饰 * 乙酰化 H4 H3 H3 H4 H3 H4 H3 H4 H2A H2B H2B H2A H2B H2A H2B H2A H2B H2A H3 H4 H2B H2A H3 H4 * 核小体核心组蛋白的化学修饰 乙酰基化 去乙酰基化 H2泛酸基化 甲基化 磷酸化 组蛋白密码 H3和H4组蛋白密码 四膜虫(Tetrahymena) Gcn5 和Rpd3 组蛋白密码，histone code H3-lys9甲基化异染色质的标志 H3-lys36、H3-lys79甲基化与常染色体和基因转录 H4-lys20，H3尾部K4（H3-Lys）、K9（H3-lys9）与染色体活性抑制有关 H3-lys9双甲基化修饰，H3-lys27三甲基化修饰与X染色体灭活有关 与染色体活化和可触及性有关的化学修饰 与染色体活性抑制的修饰 表观遗传学中DNA的修饰 1975，Arthur Riggs、Robin Holliday、Jhn Pugh提出甲基化修饰影响基因表达 1980，Peter Jones、Shirley Taylor报道了真核生物的甲基化修饰基因抑制（5’叠氮胞嘧啶） 1985，Adrian Bird实验室 CpG位点高度密集的区域，称为CpG岛，其长度常超过500bp，G+C的比例大于55％ 主要研究在没有DNA序列变化的基础上，基因表达的可遗传性的改变。 Pyrosequcing系统 染色体的形成 FIGURE 29.23 The 10 nm fiber is a continuous string of nucleosomes. FIGURf 29.25 The 30 nm fiber is a helical ribbon consisting of two parallel rows of nucleosomes coiled into a solenoid. FIGURE 29.24 The 30 nm fiber has a coiled structure. Photo courtesy of Barbara Hamkalo, University of California, Irvine. FIGURE 29.47 Su(Hw)/mod(mdg4) complexes are found at the nuclear periphery. They may organize DNA into loops that limit enhancer-promoter interactions 染色体的包装方式 一级 二级 三级 四级 * * 3常染色质和异染色质 组成性异染色质 constitutive heterochromatin 功能性异染色质facultative heterochromatin 异染色质通常在DNA复制的晚期进行复制 异染色质DNA通常处于甲基化修饰状态 与异染色质结合的组蛋白处于较低水平的乙酰化 异染色质的H3组蛋白通常会在N端第九位赖氨酸残基发生甲基化 异染色质不参与基因重组 异染色质区通常在有丝分裂过程中趋向凝聚 4染色体显带技术 1968年，瑞典学者卡斯珀松(T.O.Caspersson，1910-)首次应用荧光染料氮芥喹叶因处理染色体标本，发现染色体因着色不同能够沿其纵轴显示出宽窄和亮度不同的荧光带 人类G带核型，G带显示的是染色体上富含AT的区域 人类Q带核型，Q带显示的带纹与G带相似 人类C带核型，C带显示的是着丝粒异染色质 5异染色质形成的分子机制 位置效应（position-effect of variegation，PEV） 1930，英国爱丁堡大学 黑腹果蝇的星眼、拟星眼拟等位基因的顺（下图）反（上图）位置效应 组蛋白去乙酰基转移酶，组蛋白甲基转移酶 基因沉默的蛋白质：Sir2,3,4 6端粒的异染色质化和基因沉默 Dt 环 Sir2p Sir3p Sir4p H4 R1,R2 domain * 7着丝粒的异染色质化 * 8核小体的再塑和调整 酵母swi（switch,SWI）和snf（sucrose non-fermenting）突变基因影响交配型转型基因HO及与发酵有关的SUC2, ADH2, GAl2, GAl4基因的转录 同时缺失swi/snf, H2A/H2B的基因可以回复SUC2 同时缺失swi/snf, H3/H4的基因可以回复SUC2 1994报道swi/snf复合体含有10个亚基 1994 Car