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高中数学论文 图形算器应用能力测试活动学生 利用CASIO计算器模拟蛋白质翻译过程
辽宁省沈阳市第十五中学2013年高中数学论文 图形计算器应用能力测试活动学生 利用CASIO计算器模拟蛋白质翻译过程
「研究目的」
卡西欧图形计算器有着各种强大的功能,脱口而出的就有:函数、编程、数列、统计等,但我最熟悉的还是动态函数功能,我想我能不能就利用这个功能,通过构造不同的动态函数,模拟生物细胞内,基因指导蛋白质合成的过程呢?
「名词解释」
基因:具有遗传信息的DNA片段。
mRNA:信使RNA,替DNA传递遗传信息。
氨基酸:组成蛋白质的基本单位。
核糖体:细胞内的一种细胞器,一个生产氨基酸的“车间”。
肽链:几个氨基酸通过脱水缩合而结合在一起的化合物。
「研究背景」
蛋白质是细胞内含量最高的有机物,可分为:结构蛋白、酶、运输蛋白、抗体、激素等多种。因此,对于生物而言,一切生命活动都离不开蛋白质,蛋白质是生命活动的主要承载者。
蛋白质的合成也显得格外重要。首先,第一步是转录,以DNA的一条链为模版、细胞核中游离的RNA为材料,合成一条mRNA。然后就是翻译了,既是将mRNA上的遗传信息翻译成有一定顺序的氨基酸序列。
「模拟目标」
实际效果:
核糖体与mRNA结合并沿着其移动识别遗传信息。
携带着氨基酸的tRNA在核糖体内与对应的遗传信息结合。
一个个氨基酸与tRNA脱离并在核糖体内脱水缩合组成肽链,tRNA则离开。
随着核糖体对遗传信息的识别,这条氨基酸链会越来越长。
模拟效果:
一个圆形的核糖体沿着静止的mRNA从右边一直移动到左边。
tRNA携带着氨基酸从别的地方(当前屏幕外)进来。
tRNA在mRNA上、核糖体内将氨基酸放下然后离开。
核糖体一边走一边将tRNA上氨基酸结合起来,然后带着它们一起移动。
「具体步骤」
说干就干,我们一起按步骤来完成翻译过程吧!
绘制mRNA
首先,启动卡西欧图形计算器fx-CG20。
由于翻译的过程比较复杂,在这里将mRNA作为静止的,并将其设为背景。按5进入图形功能,这里只能编辑静态函数。
为了更好地观察函数的变化我们调整一下窗口的大小,依次输入:Len7l7lNNn4l4l
设置后如图:
输入:Y1=-3,如下图:
为了区别于其他动态函数,我们把它的线条加粗,依次按键:rqw。按l绘图,其图像画出来应如下图:
然后,为了把图像提取出来当背景用,所以将坐标轴等内容去掉,将图像保存在计算器里。先按Lp进入设置(如下图),向下翻页将Grid、Axes、Label三项设为off。
现在的图像为右图所示:。
按L7捕捉图像,输入1即图像名称为Capt01。
再按Lp再次进入设置,找到Background这项,按e进入选择背景图像的文件,按l打开Capt文件夹,第一个文件便是我们之前捕捉到的图像。
再按l便可将图像设置为背景。
绘制核糖体
mRNA画好了,那接下来就是核糖体,按p回到主菜单,按6进入动态函数的绘制界面。
按ee进入参数函数输入模式。依次按:
jaf+1.5k+1.5hfl
n3+1.5jfl
绘制氨基酸
核糖体完成了,接下来就该轮到氨基酸了。
依次输入:
af+0.75hfl
jL4NNNNNNlaf$+L4laf+7$-10k+0.75jfl
绘制tRNA
氨基酸也画完了,最后就剩下tRNA啦。
依次输入:
afl
2f-2.25,L+L4laf$,L4laf$+0.75L-l
设置变量
函数输好后接下来就是设置变量了。按rw进入变量范围设置
依次输入7ln7ln1l使得变量A从7开始变化,每次减少1直到A等于-7为止。
再按de进入变化速度设置,按q将速度设置为单步执行。
检验
万事俱备只欠检验啦!函数什么的全都输好了,接下来就是检验的时刻。
按ll命令机器开始画图!稍微片刻~
画好之后每按一下$函数就变化一次,快速地不断按便会产生一种动画的感觉。
「修改提升」
虽然完成了,但是画面上只有一个孤单的氨基酸,这太使人伤心了,我们来加多几个吧!
第二个氨基酸:
jaf+1.5k+0.75hfl
jL4laf+1.5$+L4laf+7$-8.5k+0.75jfl
第二个tRNA:
af+1.5l
2f-2.25,L+L4laf+1.5$,L4laf+1.5$+0.75L-l
第三个氨基酸:
jaf+3k+0.75hfl
jL4laf+3$+L4laf+7$-7k+0.75jfl
第三个tRNA:
af+3l
2f-2.25,L+L4laf+3$,L4laf+3$+0.75L-l
因为第二个氨基酸的最低点在x=1.5时出现,所以这次要将变量稍微调整一下:
rwNNn0.5l
接下来再次试验!仍然是按ll
呀-.-等待总是漫长的···
大功告成~耶!
「研究总结」
虽然经过努力,把翻译
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