高中数学论文 图形算器应用能力测试活动学生 利用CASIO计算器模拟蛋白质翻译过程.docVIP

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高中数学论文 图形算器应用能力测试活动学生 利用CASIO计算器模拟蛋白质翻译过程

辽宁省沈阳市第十五中学2013年高中数学论文 图形计算器应用能力测试活动学生 利用CASIO计算器模拟蛋白质翻译过程 「研究目的」 卡西欧图形计算器有着各种强大的功能,脱口而出的就有:函数、编程、数列、统计等,但我最熟悉的还是动态函数功能,我想我能不能就利用这个功能,通过构造不同的动态函数,模拟生物细胞内,基因指导蛋白质合成的过程呢? 「名词解释」 基因:具有遗传信息的DNA片段。 mRNA:信使RNA,替DNA传递遗传信息。 氨基酸:组成蛋白质的基本单位。 核糖体:细胞内的一种细胞器,一个生产氨基酸的“车间”。 肽链:几个氨基酸通过脱水缩合而结合在一起的化合物。 「研究背景」 蛋白质是细胞内含量最高的有机物,可分为:结构蛋白、酶、运输蛋白、抗体、激素等多种。因此,对于生物而言,一切生命活动都离不开蛋白质,蛋白质是生命活动的主要承载者。 蛋白质的合成也显得格外重要。首先,第一步是转录,以DNA的一条链为模版、细胞核中游离的RNA为材料,合成一条mRNA。然后就是翻译了,既是将mRNA上的遗传信息翻译成有一定顺序的氨基酸序列。 「模拟目标」 实际效果: 核糖体与mRNA结合并沿着其移动识别遗传信息。 携带着氨基酸的tRNA在核糖体内与对应的遗传信息结合。 一个个氨基酸与tRNA脱离并在核糖体内脱水缩合组成肽链,tRNA则离开。 随着核糖体对遗传信息的识别,这条氨基酸链会越来越长。 模拟效果: 一个圆形的核糖体沿着静止的mRNA从右边一直移动到左边。 tRNA携带着氨基酸从别的地方(当前屏幕外)进来。 tRNA在mRNA上、核糖体内将氨基酸放下然后离开。 核糖体一边走一边将tRNA上氨基酸结合起来,然后带着它们一起移动。 「具体步骤」 说干就干,我们一起按步骤来完成翻译过程吧! 绘制mRNA 首先,启动卡西欧图形计算器fx-CG20。 由于翻译的过程比较复杂,在这里将mRNA作为静止的,并将其设为背景。按5进入图形功能,这里只能编辑静态函数。 为了更好地观察函数的变化我们调整一下窗口的大小,依次输入:Len7l7lNNn4l4l 设置后如图: 输入:Y1=-3,如下图: 为了区别于其他动态函数,我们把它的线条加粗,依次按键:rqw。按l绘图,其图像画出来应如下图: 然后,为了把图像提取出来当背景用,所以将坐标轴等内容去掉,将图像保存在计算器里。先按Lp进入设置(如下图),向下翻页将Grid、Axes、Label三项设为off。 现在的图像为右图所示:。 按L7捕捉图像,输入1即图像名称为Capt01。 再按Lp再次进入设置,找到Background这项,按e进入选择背景图像的文件,按l打开Capt文件夹,第一个文件便是我们之前捕捉到的图像。 再按l便可将图像设置为背景。 绘制核糖体 mRNA画好了,那接下来就是核糖体,按p回到主菜单,按6进入动态函数的绘制界面。 按ee进入参数函数输入模式。依次按: jaf+1.5k+1.5hfl n3+1.5jfl 绘制氨基酸 核糖体完成了,接下来就该轮到氨基酸了。 依次输入: af+0.75hfl jL4NNNNNNlaf$+L4laf+7$-10k+0.75jfl 绘制tRNA 氨基酸也画完了,最后就剩下tRNA啦。 依次输入: afl 2f-2.25,L+L4laf$,L4laf$+0.75L-l 设置变量 函数输好后接下来就是设置变量了。按rw进入变量范围设置 依次输入7ln7ln1l使得变量A从7开始变化,每次减少1直到A等于-7为止。 再按de进入变化速度设置,按q将速度设置为单步执行。 检验 万事俱备只欠检验啦!函数什么的全都输好了,接下来就是检验的时刻。 按ll命令机器开始画图!稍微片刻~ 画好之后每按一下$函数就变化一次,快速地不断按便会产生一种动画的感觉。 「修改提升」 虽然完成了,但是画面上只有一个孤单的氨基酸,这太使人伤心了,我们来加多几个吧! 第二个氨基酸: jaf+1.5k+0.75hfl jL4laf+1.5$+L4laf+7$-8.5k+0.75jfl 第二个tRNA: af+1.5l 2f-2.25,L+L4laf+1.5$,L4laf+1.5$+0.75L-l 第三个氨基酸: jaf+3k+0.75hfl jL4laf+3$+L4laf+7$-7k+0.75jfl 第三个tRNA: af+3l 2f-2.25,L+L4laf+3$,L4laf+3$+0.75L-l 因为第二个氨基酸的最低点在x=1.5时出现,所以这次要将变量稍微调整一下: rwNNn0.5l 接下来再次试验!仍然是按ll 呀-.-等待总是漫长的··· 大功告成~耶! 「研究总结」 虽然经过努力,把翻译

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