实验室Linux下BLAST的使用.docxVIP

Linux下BLAST+的使用注意，此blast已更名为blast+，目前网上中文教程多为11年之前的老版本的blast的教程，此教程为最新版本1. 软件简介核苷酸及蛋白质序列比对2.软件获取及安装2.1.获取在window系统下，利用浏览器，进入：/blast/executables/blast+/LATEST/中下载blastlinux64位（目前最新版本：ncbi-blast-2.2.29+x64-linux.tar）。2.2.官方文档见本文件夹中的CmdLineAppsManual.pdf文档2.3.安装步骤2.3.1利用putty软件进入home文件夹#cd/home2.3.2创建一个自己的英文文件夹#mkdirXX2.3.3进入xx文件夹#cd/XX2.3.4利用winscp软件将在windows中下载的blast压缩文件包放入其中xx文件夹中直接拖拽即可2.3.5利用putty软件解压下载后被拖拽近XX文件夹的blast压缩文件包#tar-xvzf文件名2.3.6修改文件夹名为blast#mv解压后的文件夹名称blast2.3.7利用winscp软件将blast文件夹中bin目录下的文件全部拷贝至/usr/local/bin下2.3.8利用putty软件在自己建立的XX文件夹中制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/XX下#ln-s/home/xx/b