浙大(参考)生统实验报告3.docxVIP

本科实验报告课程名称：生物统计学及试验设计姓名：陈心源学院：农业与生物技术学院系：园艺专业：园艺学号：3120100418指导教师：朱军/徐海明2014年6月3日实验报告课程名称：生物统计学及试验设计指导老师：徐海明成绩：__________________实验名称：协方差分析和混合线性模型分析一、实验目的和要求（必填）二、实验内容和原理（必填）三、实验材料与试剂（必填）四、实验器材与仪器（必填）五、操作方法和实验步骤（必填）六、实验数据记录和处理七、实验结果与分析（必填）八、讨论、心得实验目的和要求学习协方差分析与二因素析因分析的方法。了解SAS、QTModel、QTLNetwork等软件的数据分析功能，以及SAS和QTModel软件的分析效益。比较回归分析、相关分析、方差分析、MCIM定位分析的优劣。实验内容和原理2.1二因素协方差分析方法2.2 QTModel分析方法2.3 QTL定位分析方法2.4 回归分析、相关分析、方差分析方法主要仪器设备计算机（使用SAS软件、QTModel软件、QTLNetwork软件）操作方法与实验步骤4.1二因素协方差分析以2个品种2个水分水平的鲜花产量为依变量，重复6次：（1）以小区面积为x变量，进行二因素协方差分析，分析品种、水分对鲜花产量的影响，对显著的效应进行适当的比较；（2）比较协方差分析与二因素析因分析结果之间的差异。4.2水稻品种区域试验分析水稻五个品种在二年和三试点三个区组的品种区域试验数据（删除了二个异常值）储存在数据文件(RiceTrial-2.txt)中。（1）采用SAS软件的Proc GLM，Proc Mixed和Proc VarCom分析该数据，并对品种的表现作适宜的推断；（2）采用QTModel软件分析该数据，对品种的表现作适宜的推断；（3）比较SAS软件和QTModel软件的分析效益。4.3 QTL定位分析采用QTLNetwork软件分析控制仿真群体表现型值的QTL定位数据（DHSim.map和DHSim.txt）。（1）估算QTL的位置和遗传效应，对群体的QTL位置和遗传效应作统计推断；（2）把QTL定位结果和实验一的分析结果都与仿真的参数真值作比较，比较所采用的四种分析方法（回归分析、相关分析、方差分析、MCIM的定位分析）用于推断群体基因定位的可靠性及统计方法的优缺点。五、实验数据记录和处理（一）二因素协方差分析Data Flower; Input A $ B $ Y X @@;Datalines;数据;PROCGLM;Class A B ;MODEL Y = X A|B;LsMeans A B/STDERRPDIFFAdjust=Tukey ETYPE=3;LSMeans A*B/STDERRPDIFFAdjust=Tukey ETYPE=3;RUN;PROCGLM;Class A B ;MODEL Y = A|B;LsMeans A B/STDERRPDIFFAdjust=Tukey ETYPE=3;LSMeans A*B/STDERRPDIFFAdjust=Tukey ETYPE=3;RUN;1、二因素协方差分析运行结果由上述结果可得，模型极显著。由变量显著性分析可知，主因素X(小区面积)、A(品种)和B(水分)对Y（鲜花产量）具有显著性影响，而A(品种)和B(水分)的互作对Y（鲜花产量）的影响不显著，所以可以对单独的因素进行分析。由以上结果分析可知：对于品种因素单一分析，LP品种产量均比WB品种产量高；对于水分因素单一分析，Low水平产量均比High水平产量高。2、二因素析因分析运行结果由结果可知，模型的PrF值=0.22660.05且 R-Square=0.191113，故模型不显著。并且，无论是主因素A、B还是两者的互做效应，对Y（鲜花产量）都没有显著性的影响。由以上结果可知：因为PrF值=0.1399，对于A(品种)因素单一分析，无法得到LP品种产量均比WB品种产量高，即LP与WB均不存在显著性差异。因为PrF值=0.1399，对于B(水分)因素单一分析，无法得到Low水平产量均比High水平产量高，即High与Low不存在显著性差异。由结果分析知：各因素不同水平组合之间的比较产量差异均不显著。（二）水稻品种区域试验分析1、SAS程序:data Rice;input Gen Year Loc Block Yield;datalines;;procGLM;Class Gen Year Loc Block;MODEL Yield = Gen Year Loc Year*Loc Gen*Year Gen*Loc Gen*Loc*Year Block(Year*Loc);Random Year Loc Year*Loc Gen*Year Gen*Lo