肺癌个体化治疗技术分析.pptxVIP

肺癌个体化治疗相关分子标记的研究进展 北京协和医院 曾瑄 肺癌的驱动基因 90酪氨酸激酶（TKs） 56跨膜 （i.e.受体酪氨酸激酶, RTKs） 518蛋白激酶 34非跨膜 丝氨酸/苏氨酸激酶（STKs） 脂质激酶 NSCLC中，驱动突变的关键基因大多数为信号传导蛋白 (如蛋白激酶) 编码基因， 信号传导蛋白通过将磷酸基团从ATP转移至特异性靶蛋白，调节细胞增殖和生存。 NSCLC中，驱动突变也常见于编码GTP结合蛋白的基因， G蛋白通过与下游分子的相互作用，调节细胞生长、分化和凋亡。 肺癌驱动基因 酪氨酸激酶 丝氨酸/苏氨酸激酶 脂质激酶 RAS–RAF–MEK–ERK pathway PI3K–AKT–mTOR pathway Lung Cancer Adenocarcinoma ~ 50% in Chinese Squamous Cell Cancer 驱动基因异常及临床意义 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 J Clin Oncol 31:1097-1104, 2013 J Clin Oncol 31:1097-1104, 2013 分子检测技术 蛋白检测 RNA检测 chromosome DNA检测 新一代测序技术 一代 Sanger Sequencing 二代 Roche - 454 Illumina – GA II SOLiD 三代 Helicose PacBio Illumina = HiSeQ, MiSeq Ion Torrent Oxford Nanopore 3730XL (2002) GS-FLX/Titanium [454] (2005) G1/G2 [Illumina](2006) SOLiD v2.03/3.0 [ABI](2007) Heliscope[Helicose] (2008) Pacific Bio (2009) Complete Genomics (2009) Seq. Chem. Sanger Pyroseq SBS SBL SBS SBS SBL Read length (bp) 800 225-400 33-75 33-50 25 800 32 # of reads/run 96-384 400,000 – 1 x 106 40-100 x 106 40-100 x 106 500 x 106 TBD NA Accuracy 99.999% 99.5% 99.0% 99.94% 99.95% TBD TBD Cost/Mb $800 $80 $5 $4 $3 TBD $2 各种NGS比较 NGS: Next Generation Sequencing 分子检测方法的选择 检测试剂 方法：伴随诊断 Companin diagnotics 在非小细胞肺癌中已确定了几种EML4-ALK 融合变异体，并证明其具有功能活性 转化需要ALK酪氨酸激酶的活性。 证据表明ALK抑制剂可致体内肿瘤缩小 ，提示癌基因依赖，可以作为潜在的靶点 非小细胞肺癌中的ALK基因 融合 ALK激酶结构域 （～80%, 其中81%， 未知19%） （～20%） HIP1-ALK ...... ...... J Thorac Oncol. 2014;9: 285–294 举例 ALCL: 间变性大细胞淋巴瘤 IMT: 炎性肌纤维母细胞瘤 DLBCL: 弥漫大B细胞淋巴瘤 NSCLC: 非小细胞肺癌 KIF5B-ALK t(2;10)(p23;p11) 肿瘤中已知的ALK融合基因类型 荧光原位杂交 ALK (+) Fluorescence in situ hybridization, FISH ALK: Anaplastic Lymphoma Kinase 2p21 EML4 Positive: 15% 70% 30% 分离 缺失 ALK临床研究的数据均使用FISH诊断 PROFILE 1001 PROFILE 1005 PROFILE 1007 PROFILE 1014 PROFILE 1029 I期临床 II期临床 III期临床 分离探针FIS