第2章 蛋白质的构件--氨基酸.ppt

第2章??蛋白质的构件-氨基酸(amino acid) 一、蛋白质的化学组成和分类 1.元素组成 蛋白质是一类含氮有机化合物，除含有碳、氢、氧外，还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素，主要是磷、铁、碘、锌和铜等。碳和氮元素在蛋白质中的组成百分比约为：碳 ：50%; 氮：16%。 2.蛋白质的估算 平均含氮量约为16%，所以，可以根据样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量： 蛋白质含量=蛋白氮×6.25 3.氨基酸组成 蛋白质是由20种L-型α氨基酸 组成的长链分子 4.蛋白质的分类 1） 按组成： 简单蛋白质（表2－1）： 缀合蛋白质（表2－1） ：（注意辅基的组成） 2）按生物学功能分 ： 酶、运输蛋白、营养和贮存蛋白、激素、受体蛋白、运动蛋白、结构蛋白、防御蛋白等。 3）按形状和溶解度： 纤维状蛋白质：不溶于水,结构作用； 球状蛋白质 ：易溶于水，细胞中大多属可溶性蛋白； 膜蛋白质：不溶于水, 与细胞的各种膜系统结合。 酸水解：H2SO4或HCI能使蛋白质完全水解；不引起消旋作用，但色氨酸完全被破坏，天冬酰胺、谷胺酰胺脱酰胺基； 碱水解：NaOH能使蛋白质完全水解；色氨酸稳定，但大多数氨基酸遭破坏并引起消旋现象； 酶水解：部分水解；不产生消旋，不破坏氨基酸；主要用于蛋白质一级结构分析，如：胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶等。 二、蛋白质的水解 三、氨基酸的一般结构?????????? 结构通式：与羧基相连的Cα上都有一个氨基，氢原子和可变的R基。如图aa结构通式： 除Gly外 , Cα是不对称C ： 1.具有两种立体异构体 [D-型和L-型] 2.具有旋光性 [左旋（-）或右旋（+）] 四、氨基酸的分类 （一）基本氨基酸：组成蛋白质的常见氨基酸（有20种）。 （二）不常见的蛋白质氨基酸：不常见但在某些蛋白质中存在。是多肽合成后由基本aa经酶促修饰而来(约10种)。 （三）非蛋白质氨基酸：存在于生物体内但不参与蛋白质组成的氨基酸(约200多种)。 按R基的化学结构： 中性氨基酸 1.脂肪族氨基酸 含羟基或硫的氨基酸 酸性氨基酸及其酰氨 碱性氨基酸 2.芳香族氨基酸 3.杂环族氨基酸 （一）?常见的蛋白质氨基酸（20种） （1）中性氨基酸（5种，甘丙缬亮异） R基均为中性烷基，R基对分子酸碱性影响很小。 Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸，因此不具旋光性 。 1. 脂肪族氨基酸 （2） R中含有羟基和硫的氨基酸（共4种，丝苏半甲硫） Cys的R中含巯基（-SH），具有重要性质： 两个Cys的巯基氧化生成二硫键，生成胱氨酸。 Met在生物合成中是一种重要的甲基供体（ ★ ）。 （3）酸性氨基酸及其酰胺基团（各2种，天谷酸酰胺） Asp和Glu是唯一在生理条件下带有负电荷的的两个氨基酸； （4）碱性氨基酸（2种，赖精脂肪酸） Arg是碱性最强的氨基酸，是动物体内尿素形成的中间物。 2.芳香族氨基酸（3种，苯丙色酪香） 苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸 3.杂环氨基酸（2种，杂环带组脯） Pro的α-亚氨基是环的一部分，因此具有特殊的刚性结构，一般出现在两段α-螺旋之间的转角处，Pro残基所在的位置必然发生骨架方向的变化； His带有咪唑基，是在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸。His在酶的酸碱催化机制中起重要作用。 按R基的极性性质： 1.非极性R基氨基酸8（丙、缬、亮、异亮、脯、苯丙、色、甲硫） 2.不带电荷的极性R基氨基酸7（甘、丝、苏、半胱、酪、谷氨酰胺、天冬酰胺） 3.带正电荷的R基氨基酸3（赖、精、组） 4.带负电荷的R基氨基酸2（谷、天冬） 极 性 1.非极性R基氨基酸（8种） 在水中的溶解度小，且在维持蛋白质的三维结构（蛋白质的疏水核心）中起着重要作用。 2.不带电荷的极性R基氨基酸（7种） 这类氨基酸的侧链都能与水形成氢键，因此很容易溶于水。 羟基 巯基 酰胺基 3.带负电荷的R