gromacs模拟混合膜模拟教程.docxVIP

1.Bacterial Lipids：/?doc=archivelib=lipid混合膜的文章：/biophysj/abstract/S0006-3495(09)00791-7/biophysj/abstract/S0006-3495(09)00791-7混合膜的使用： /?doc=input/membrane_onlystep=1/?doc=input/membrane_onlystep=1这是一个教程：/?doc=tutorialproject=membranechapter=membrane_vdac_heterosub=intro/?doc=tutorialproject=membranechapter=membrane_vdac_heterosub=intro2.Peter Tieleman：http://www.ucalgary.ca/tieleman/?page=Structures_and_Topologies发表的文章：http://www.ucalgary.ca/tieleman/publicationsChol（胆固醇）模拟视频：http://www.ucalgary.ca/tieleman/gallery/video-gallery3. 金黄色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus ) 是人类的一种重要病原菌，隶属于葡萄球菌属（Staphylococcus），有“/view/5593629.htm嗜肉菌的别称，是革兰氏阳性菌的代表，可引起许多严重感染。万古霉素（Vancomycin）是抗生素的一种，其分子式为C66H74ClN9O24。可抑制细菌细胞壁的合成，对金黄色葡萄球菌、化脓/view/426172.htm链球菌、肺炎链球菌等作用强，对难辨校状芽孢杆菌、/view/668816.htm炭疽杆菌、/view/36161.htm白喉杆菌等作用也良好。/view/30494.htm/view/30494.htm/zh/%E9%87%91%E9%BB%83%E8%89%B2%E8%91%A1%E8%90%84%E7%90%83%E8%8F%8C/zh/%E9%87%91%E9%BB%83%E8%89%B2%E8%91%A1%E8%90%84%E7%90%83%E8%8F%8CGROMACS 安装：首先安装Cmake（gromacs安装是需要用到Cmake）：1）下载地址：/download/2）Linux服务器本地安装命令（使用GNU编译器编译）：安装fftw（gromacs用于计算傅里叶变换）：wget /pub/fftw/fftw-3.3.4.tar.gz?tar?zxvf?fftw-3.3.4.tar.gz?cd?fftw-3.3.4/?./configure --prefix=/home/amber/soft/fftw3/(选择你自己的安装目录) --enable-sse2 --enable-float --enable-shared?make?-j?make?install安装gromacs：下载地址：/Downloads/Downloadslinux服务器本地安装命令： export?CMAKE_PREFIX_PATH=/home/amber/soft/fftw3/cd?gromacs-5.0.4/? mkdir?build?cd?build/cmake?..?-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/gromacs5?-DGMX_MPI=on?make?-j?make?install3)在~/.bashrc中更改设置：