高通量测序在肿瘤研究中的应用.pptx

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2016-12-16 发布于湖北
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高通量测序在肿瘤研究中的应用

高通量测序在肿瘤研究中的应用XXXXXX年XX月肿瘤是基因突变逐渐累积的结果高通量测序为肿瘤研究提供新方法肿瘤研究思路肿瘤DNA水平表观水平RNA水平DNA水平全基因组测序外显子组测序方法检测范围优点缺点全基因组测序全基因组范围获得整个基因组全面信息可检测所有类型突变错过低频突变海量数据分析相对困难外显子组测序1-2%基因组序列经济高效，测2%基因组测序深度高，利于低频突变检出检测编码区，数据效率高，更易于分析错过部分非编码区突变对大片段结构变异检测较差DNA水平绘制肿瘤突变谱，发现特定肿瘤类型高频突变基因特定基因突变热点分析，发现新的原癌基因和抑癌基因RNA水平针对样品在特定组织特定状态下的全部mRNA进行分析鉴定转录本结构变异鉴定差异表达基因变异基因及差异表达基因功能注释表观遗传水平免疫共沉淀测序通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等相互作用的DNA区段信息DNA进行重亚硫酸盐处理并高通量测序,检测所有的甲基化位点，绘制单碱基分辨率的DNA甲基化图谱免疫共沉淀测序甲基化测序