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生物技術研究所 生物資訊學 第一次作業 學號：0941101XXX 姓名：OOO 說明此酵素蛋白之功能 Protein：Myoglobin () EC Number: 1.1.1.27 Myoglobin是一種肌紅蛋白，分子量約17800，主要分佈在肌肉組織中，其主要功能為儲存氧氣，並提供氧氣給正在運作的肌肉。一些潛水的動物如海豹、鯨魚等，牠們能夠進行長時間潛水的主要原因就是因為牠們的肌肉中含有大量的myoglobin。 Myoglobin的結構中含有8個α helix，分別標示為A-H。在這些helix上的amino acid，若為hydrophobic，則其R group均面向內側；若為hydrophilic，則其R group均面向外側。而這造成了myoglobin可溶於水的特性。 Myoglobin與hemoglobin很像，都具有heme這種能夠與氧氣結合的分子。每一個myoglobin在其hydrophobic cleft處都含有一個heme，heme內含有鐵離子，鐵離子除了與heme中的四個氮離子結合外，另外還與myoglobin中F helix上的histidine 93的R group及E helix上的histidine 64的R group結合。heme就是靠著上述的作用力而能與myoglobin緊密結合，而氧氣就是透過與鐵離子之間的作用力而與myoglobin結合的。氧氣與myoglobin之間的結合比其與hemoglobin之間的結合還要更強，使myoglobin能夠順利扮演儲存氧氣的角色。下圖是myoglobin 與血紅素β次單位結構的比較，其三級結構的相似性是顯而易見，其結構的差異性只不過是helical structure的長短及helixes 之間loop大小不同而以（→標示區）。列出所選擇之物種,編號 Homo sapiens (human)─人類 giEquus caballus (horse)─馬 gi:1942750 Mus musculus (house mouse)─老鼠 giThunnus albacares (yellowfin tuna)─金槍魚(黃鰭) gi:9930600Accipiter gentilis fujiyamae─蒼鷹giPan troglodytes (chimpanzee)─黑猩猩 gi:127683 Symphalangus syndactylus (siamang) ─合趾猿 giacaca fascicularis (crab-eating macaque) ─恒河猴 gi:127671Sus scrofa (pig) ─豬giTupaia glis (common tree shrew) ─鼩鼱gi:127698 Lutra lutra (Eurasian river otter) ─歐亞水獺girycteropus afer (aardvark) ─土豚gi:127682 Ctenodactylus gundi (northern gundi) ─獵犬gi:127646 Ochotona princeps (American pika) ─美國短耳野兔gi:127679 Erinaceus europaeus (western European hedgehog) ─豪豬 gi:127650 Nannospalax ehrenbergi (Ehrenbergs mole-rat) ─鼴鼠gi:127695Oryctolagus cuniculus (rabbit) ─兔 gi:127691 Globicephala melas (long-finned pilot whale) ─長肢領航鯨gi:127655Ondatra zibethicus (muskrat) ─麝鼠gi:417334 Tursiops truncatus (bottle-nosed dolphin) ─瓶鼻海豚gi多重序列比對結果  分類演化樹結果 討論分類演化樹與物種之相關性 在課堂上，老師諸說著演化樹與物種之間的相關性，可以從分子演化與形態演化上，來探討生物多樣性或物種分類的多歧性。 從以前的林奈物種系統分類中，有很多重要物種的分類，根據其特徵。舉例來說：四隻腳的動物，似乎都是從兩棲類演化而來，我們會看到海豚四肢達爾文提出的定律是不容易被突變的。演化得來不易。也就是說，突變演化的生物，不容易失去他的特徵。在演化樹