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分子遗传3
第三章 DNA损伤及修复
1.DNA损伤类型:氧化、射线、碱基突变、插入、转换、颠换
2.修复途径:错配修复、RecBCD途径;光修复、移位修复;
错配修复:(1) 识别错配的碱基对;(2) 对错配的一对碱基要能准确区别哪一个是错的,哪一个是对的;(3) 切除错误的碱基,并进行修复合成。
MutS能识别错配位点,MutL能作用新合成的链,UrrD是解旋酶可使错配区双链打开,然后SSB结合在单链上防止复性,MutH作为外切酶将含有错配碱基的新链片段切除掉,再由DNA PolⅠ进行修补,最后由连接酶把裂缺封闭好。这样就完成了错配修复。
RecBCD途径:
3.修复系统目标,什么酶包含在每一个修复途径中?
4.MutS和DisA功能比较?新合成的链中MutS的功能,它是怎样识别新链?
MutS:
DisA:
MutS的功能:
新链识别:
5.SOS修复;怎样介导?
SOS修复:
介导:
第三章 DNA重组
第三章重组
1. The recombination event is guided by a set of proteins. RecA.Rad52
重组事件由一系列蛋白指导。RecA.Rad52
(大肠杆菌中涉及重组的酶)
Rad52: 真核中存在,链交换蛋白组装,在原核中起此作用的是RecBCD RecBCD系统 具有核酸酶,解旋酶和ATPase活性。在Chi位点产生单链3ˊ游离未端;
RecBCD酶作用于断裂的DNA分子以产生单链DNA区域。 RecB,RecC,RecD RecBCD是ATP依赖的外切酶和解旋酶(外切酶V),它与双链断口结合,解开DNA并导入裂口,其倾向性位点称为chi。RecBC解旋酶活性,RecD去掉后RecBCD失去核酸酶活性。 RecA(真核Rad51) 同源DNA联会及促进链侵入。(1)具有蛋白酶活性; (2) 在单链DNA和ATP存在的条件下RecA能启动DNA单链和与之互补的双链分子进行碱基配对。 *(RecG 具有解旋酶活性,可解离Holliday连接) RuvAB系统 Hollidy联结体识别和分支移位。(具有解离Holliday连接的活性) RuvA 特异性结合Holliday联结体 RuvB 是一种ATPase,它可发动迁移反应 RuvC 拆分Holliday联结体。
2. These breaks are processed into single standed 3’end RecBCD
这些片段被加工成单链3’末端RecBCD蛋白
3. The single standed 3’invades a homology partner DNA duplex which catalyzed by RecA family Proteins
单链3’侵入一被RecA蛋白家族催化的同源的partner DNA双螺旋(RecA蛋白使单链DNA取代双链DNA中的同源部分)
RecA操作DNA的活性之一能使单链DNA取代双链分子中同源的链,此反应称为单链取代(single-strand uptake)或单链同化(single-strand assimilation)这种取代反应能发生在各种形状的DNA分子之间,但一般要具备三个条件:①其中一个DNA分子必须要有一个单链区域;②其中一个DNA分子必须要有一个游离的3′末端;③此单链区域和3′末端必须和另一个DNA分子有互补区。
4. Branch migration(RuvAB) accompanied by limited DNA synthesis then leads to the formation of four-standed structures known as Holiday junctions
伴随限制性DNA合成发生的分支移位(RuvAB)导致叫做Holiday junctions的四分体结构的形成
同源DNA分子的联会
引入DNA断裂
链侵入
Holliday联结体的移动(分支移位)
Holliday联结体的剪切
Figure 22.2 The Holliday model of recombination. (a) Nicks occurin the same places in homologous chromosomes (blue and red).(b) Strands of the two chromosomes exchange. (c) Nicks are sealed,permanently joining the two chromosomes through two of their fourstrands and yielding a
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