第五章蛋白质的三维结构(一)程序.pptVIP

J.M.G. G. N. Ramachandran and his coworkers in Madras, India, first showed that it was convenient to plot to show the distribution of allowed values in a protein or in a family of proteins. A typical Ramachandran plot is shown in this figure. 第五节 纤维状蛋白质 （Fibrous proteins） 是支架和外保护， 占脊椎动物体内蛋白质总量的一半或一半以上。 包括：（1）不溶性（硬蛋白，如：角蛋 白、胶原蛋白、弹性蛋白）； （2）可溶性（如：肌球蛋白、纤 维蛋白原）。 一. 角蛋白：α—角蛋白和β—角蛋白 (1) α-角蛋白（α-Keratin） (2) β-角蛋白（β-Keratin） 二. 胶原蛋白（Collagen） 三. 弹性蛋白 二. 胶原蛋白（Collagen）  Hydroxylation depends on Vitamin C . Vitamin C deficiency causes scurvy (坏血病). 第六节 超二级结构和结构域 超二级结构：标准折叠单位，折叠花式（motif） 定义： 种类： （1）αα：左手卷曲螺旋（超螺旋）。有二股、三股和四股螺旋，是纤维关蛋白的主要结构元件。序列上存在七残基重复序列。 （2）βαβ：最常见的是Rossman折叠。 （3）ββ：反平行β折叠片，最简单的是β发夹，它可形成β曲折和希腊钥匙拓扑结构。 三. ?-转角 (?-turn) ? -turn ?- 凸起（?-Bulge） 氨基酸在二级结构中出现的几率： 没有一定规律的松散肽链结构。 酶的活性部位。 四. 无规卷曲 一. 角蛋白： (1) α-角蛋白（α-Keratin） 右手α- 螺旋 原纤维（左旋的三股α- 螺旋，直径2nm） 微原纤维（直径8nm） 大原纤维（直径200nm） 硬角蛋白——含硫量高（二硫键多），如：蹄、爪、角、甲 软角蛋白——含硫量低（二硫键少），如：皮肤 (2) β-角蛋白（β-Keratin） silk fibroin 1．胶原蛋白的组织分布与类型： I型——XII型， 2．胶原蛋白的AA组成： Gly, Pro, 4-OH-Pro, 3-OH-Pro, 5-OH-Lys，胶原蛋白是糖蛋白，少量糖与5-OH-Lys的—OH共价连接。 Gly , because its small size, is required at the tight junction where the three chains are in contact. α—肽链（非α—螺旋，更伸展，左手） 三股螺旋（右手超螺旋缆） 原胶原分子 胶原（原）纤维 Tropocollagen assemble into collagen fibers. Crosslinks are formed between lysines through aldol condensation and dehydration. The newly translated collagen is hydroxylated and glycosylated and triple helices are formed. The procollagen triplexes are exported and the globular domains are cut off to form the tropocollagen Crosslink 1 Crosslink 2 Desmosine 基本单位-原弹性蛋白 两种方式交联： 三．弹性蛋白（Elastin） 第五章 蛋白质的三维结构（一） 第一节 研究蛋白质构象的方法 第二节 稳定蛋白质三维结构的作用力 第三节 多肽主链折叠的空间限制 第四节 二级结构的基本类型 第五节 纤维状蛋白质 第六节 超二级结构和结构域 第七节 球状蛋白质与三级结构 第八节 膜蛋白的结构 第九节 蛋白质折叠 第十节 亚基缔合和四级结构 第一节 研究蛋白质构象的方法 一. X射线衍射法 二．研究溶液中蛋白质构象的光谱学方法 1．紫外差光谱： 2. 荧光和荧光