遗传育种中渗入系构建原理及其应用答题.pptVIP

遗传育种中渗入系构建原理及其应用——遗传学 tasks： 什么是渗入系 渗入系的构建（QTL AB-QTL） 渗入系的应用 definition： 渗入系也被称为染色体片断代换系 Chromsomal segment substituted 渗入系 Introgression line 是通过系统回交和自交并利用分子标记辅助选择的手段使供体染色体片段渗入到受体亲本中。 由于渗入系的遗传背景与受体亲本大体相同，只有少数渗入片段的差异，渗入系和受体亲本的任何表现型差异均由渗入片段所引起，这为遗传分析和功能鉴定提供了良好的研究材料，提高了基因定位的准确性，同时渗入系构建过程也是品种选育的过程。 渗入系的提出 Paterson 等在 AB-QTL 分析法的基础上提出了 渗入系 introgression line, IL 作图群体进行 QTL 精 细定位, 为 QTL 精确定位和基因克隆及充分挖掘野 生资源当中的有利基因提供了良好方法。 QTL: 控制数量性状的基因在基因组中的位置称为数量性状基因座（QTL）；（例如：产量、品质、抗性） 利用分子标记进行遗传连锁分析，可以监测出QTL，即QTL定位； QTL定位就是检测分子标记与QTL的连锁关系，同时还可以估计QTL的效应； 分子标记类型 发展：形态标记－细胞生物学标记－生化标记－DNA分子标记 根据检测手段分为四类： DNA－DNA杂交的dna标记，其中最具代表性是发展最早且应用最广泛的RFLP; 基于PCR基础的dna标记（SSR，微卫星DNA） 基于PCR与限制酶切技术结合的DNA分子标记 基于单核苷酸多态性的DNA分子标记 QTL定位的基本原理和方法 孟德尔遗传学分析非等位基因间连锁关系的基本方法是，首先根据个体表现型进行分组，然后根据各组间的比例，检验非等位基因间是否存在连锁，并估计重组率。QTL定位实质上就是分析分子标记与QTL之间的连锁关系，其基本原理仍然是对个体进行分组，但这种分组是不完全的。根据个体分组依据的不同，现有的QTL定位方法可以分成两大类。一类是以标记基因型为依据进行分组的，称为基于标记的分析法（marker-based analysis； Soller and Beckmann 1990）；另一类是以数量性状表型为依据进行分组的，称为基于性状的分析法（trait-based analysis；Keightley and Bulfield 1993）。 基于标记的分析法 基于标记的分析法是通过检验标记的不同基因型之间的差异来推知标记是否与QTL连锁的。 DH群体中某QTL的基因型QQ和qq在连锁标记基因型MM和mm中的频率分布（分离比例）. r为标记与QTL间的重组率. 仅当r 0.5（亦即标记与QTL间没有连锁）时, QQ和qq在MM和mm中的频率分布才相同 基于性状的分析法 基于性状的分析法和分离体分组混合分析法的原理. 在DH群体中，与QTL连锁的遗传标记的两种基因型的分离比例在高值组和低值组中都会偏离1 : 1的孟德尔分离规律，其电泳带型在高值组DNA和低值组DNA间也会表现出差异, 且分别与高值亲本和低值亲本相似 渗入系的构建 AB-QTL（advanced backcross quantitative trait locus analysis） 渗入系选择及渗入片段分析 相关QTL定位 渗入系 IL-35 和 IL-36 的单株分蘖数分别为 6.9 个和 6.7 个, 极显著多于轮回亲本 Scarlett, 表明其导入 片段上存在与分蘖相关的 QTL, 利用代换作图法将其 定位 图 3 。分蘖相关 QTL 在单片段渗入系 IL-35 和 IL-36 上均被检测到, 而非重叠区段的单片段渗入系IL-34 和 IL-37 上未被检测出, 因此该 QTL 位于 4H 染 色体上 87.5 cM 到 110.0 cM 区间内, 长度为 22.5 cM, 该区间包含多态标记 MGB396。加性效应值为 0.65, 加 性贡献率为 11.8%。由于环境因素对大麦的分蘖数影 响较显著, 特别是苗期所处的温度条件, 所以不排除 环境效应的影响, 因此需要多次、多点试验进行验证。 渗入系的应用 外源基因有提高生产力的潜力 渗入系可以对数量性状进行精细定位 渗入系对理解的分子基础和植物进化、驯化过程的遗传机理具有重要意义 单个QTL精细定位 为了精细定位某个QTL，必须使用含有该目标QTL的染色体片段代换系或近等基因系（简称为目标代换系）与受体亲本进行杂交，建立次级实验群体。一个理想的染色体片段代换系应该是，除了目标QTL所在的染色体片段完整地来自供体亲本之外，基因组的其余部分全部与受体亲本相同。这样，在染色体片段代换系与受体亲本杂交的后代中，