2DNA的结构(上)探究.ppt

* 这种自治表明细菌染色体中有普适的作用域结构，如图26.5，每个作用域包括一个DNA环，DNA环的末端以某种未知方式保护，不允许转动从一个作用域向其他作用域传播。每个基因组中有约100个此类作用域；每个作用域包括约40kb（13微米）的DNA，并被组装成更紧密的纤维，这些纤维的结构已经测知。 ?独立存在的作用域允许基因组的不同区域产生不同程度的超螺旋，在考虑特殊细菌启动子的不同易感性时与超螺旋化时，这是一个主要因素（见11章）。 基因组的超螺旋有两种形式： ◆当超螺旋DNA处于自由状态时，它的超螺旋是无限制的，负超螺旋产生一个扭转张力，扭转张力在作用域里沿着DNA自由传播，解开双螺旋后消失（见5章），DNA在张力和解链状态之间达到动态平衡。 ◆蛋白质连接到DNA后，保持其特定的三维构象，超螺旋是有限制的，即受限于超螺旋结构与蛋白质之间的相互作用，该作用的能量稳定了核酸，故没有张力沿着分子传递。 大肠杆菌DNA的超螺旋仅在活体中存在吗？双螺旋易被自由DNA的扭转张力所影响吗？活体中超螺旋的测量比较困难，在分离期间限制蛋白可能已经丢失。现已用不同方法确定DNA在活体中的确处于扭转压力下，但很难用确切数字来描述DNA的超螺旋水平。 其中一种方法中使用了交连试剂——补骨脂素，当补骨脂素处于扭转张力作用下时，更容易与DNA连接。在活体中，补骨脂素与大肠杆菌DNA之间的反应显示，每200bp有一个负超螺旋转角 σ －0.05 。 另一种方法是检查细胞形成可变结构DNA的能力，如在回文序列上产生十字形。我们可以通过测量反应所需的连接数改变，来计算原始超螺旋的密度。该实验表明超螺旋结构的平均密度σ 0.025，即每100个碱基对有一个负超螺旋转角。 所以超螺旋在活体中确实产生扭转张力，其平均水平可能有所不同，虽然精确测量其密度比较困难，但显而易见，该密度已经在DNA结构上发挥了重要作用，例如，在原点或起动点特殊区域协助DNA的熔化。 核酸的许多精细结构特征仍在继续研究当中。作用域的构建有什么特性？是不是同样的序列总位于同样的相关点上？个别作用域含量可不可以漂移？生物化学独立分析是不能准确回答这些问题的，但如果有可能设计合适的选择技术，通过研究结构突变的性质，可从分子水平上分析核酸的结构。 图26.5 细菌基因组包括双链DNA（纤维形式）的许多环，每个环都因形成一个独立的结构作用域而在碱基中受到保护。 原核生物基因主要是单拷贝基因，只有很少数基因〔如rRNA基因〕以多拷贝形式存在； 整个染色体DNA几乎全部由功能基因与调控序列所组成； 几乎每个基因序列都与它所编码的蛋白质序列呈线性对应状态。 原核细胞DNA特点： 1、结构简炼。 原核DNA分子的绝大部分是用来编码蛋白质的，只有很小一部分控制基因表达的序列不转录。如在ΦX174中不转录部分只占4%左右（217/5386 ,T4 DNA中占5.1%（282/5577 。 2、存在转录单元 原核生物DNA序列中功能相关的RNA和蛋白质基因，往往丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成转录单元并转录产生含多个mRNA的分子，称为多顺反子mRNA。 3、有重叠基因。 一些细菌和动物病毒存在重叠基因，同一段DNA能携带两种不同蛋白质的信息。 1973年，Weiner和Weber在研究一种大肠杆菌RNA病毒时发现，有两个基因从同一起点开始翻译，一个在400bp处结束，而在3%的情况下，翻译可一直进行下去直到800bp处碰到双重终止信号时才停止。 1977年，Sanger正式发现了重叠基因： ΦX174感染寄主后共合成9个蛋白质，相对分子质量约2.5×105，相当于6 078个核苷酸，而病毒DNA本身只有5 375个核苷酸。 Sanger在弄清ΦX174 DNA的全部核苷酸序列及各个基因的起迄位置和密码数目以后发现，9个基因中有些是重叠的。 组蛋白： H1 H2A H2B H3 H4 非组蛋白 核小体 DNA 蛋白质 染色体 真核生物染色体的组成 第十节 真核生物染色体及其基因 端粒，着丝点和DNA复制原点是构成染色体不可缺少的三个要素 组蛋白的一般特性： 进化上的保守性 保守程度：H1 H2A、H2B H3 、H4 无组织特异性 肽链氨基酸分布的不对称性 H5组蛋白的特殊性：富含赖氨酸（24%） 组蛋白的可修饰性 组蛋白的一般特性： 1、进化上的极端保守性 保守程度：H1 H2A、H2B H3 、H4 不同种生物组蛋白的氨基酸组成十分相似。牛、猪、大鼠的H4氨基酸序列完全相同，与豌豆序列相比也只有两个氨基酸的差异。 2、无组织特异性 仅发现鸟类、鱼类及两栖类红细胞染色体不含H1而带有H5，精细胞染色体的组蛋白是鱼精蛋白这两个例外。 3、肽链上氨基酸分布的不对称