复杂多样、动态化的玉米B73系基因组.docVIP

复杂多样、动态变化的玉米B73系基因组 摘要：玉米是一种重要的粮食作物，同时也是生物学研究中的重要的模式植物之一。我们提出了一个改进的玉米基因组核苷酸序列草案，包含2.3亿个碱基对，预测了超过32，000个基因，有99.8%已定位于相关染色体上。该基因组中有接近85%是由非均匀分散于整个基因组中的几百个转座子家族，这些转座元件负责数以千计的基因碎片的复制，影响着着丝点的大小、组成和位置。我们分析了Mu转座子的插入与重组、拷因丢失与低甲基化区域之间的关联，以及该作物远古状态时染色体拷贝数从双二倍体减少至二倍体的过程中复制区差异基因丢失的关系。这些分析结果告知并为我们更进一步的调查研究阶段打下基础，以提高我们对于玉米驯化及作物改良的认识。 玉米(Zea mays ssp. mays L.)是由距今大约10,000的位于美洲中部的草类玉米驯化而来的，并被选育种植至今[1]。玉米作为一种重要的模式植物被用于以下基础性研究：基因的遗传与功能、基因与染色体的物理连锁、细胞学的交叉与重组的机械关联、核仁的起源、端粒的特性以及表观遗传沉默、印记与变换等等[2].同时，玉米又是最重要的粮食作物之一，单就美国而言，在大约8600万英亩的面积产量大概在258050.4亿立方英寸左右，价值约为470 亿美元（2008年数据 [3]）。在过去的一个世纪里，育种者将玉米产量提高了8倍[4]，杂种优势是部分杂交