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N部分-LRS
转录因子的共同特征: 1. DNA结合域: 专一性结合到某些DNA序列上,包括启动子启动子的的特异性基序 (motifs), 上游调节元件 (UREs) 或增强子区域. 2. 激活结构域 :激活转录. DNA结合结构域 螺旋-转角-螺旋结构域 新指结构域 同源域结合到特异的DNA序列上 具有螺旋-转角-螺旋结构域的不同DNA结合蛋白 二聚体化结构域 亮氨酸拉链 螺旋-环-螺旋结构 (HLH) 转录激活结构域: ? 酸性激活结构域: Gal 4 转录激活结构域中含有高比例的酸性aa, 所以称为酸性激活结构域, 是许多转录因子的共同特征 (Gcn4, Gal4, herpes virus activator VP16) ? 富含谷氨酰胺结构域:SP1 和酸性结构域一样,Glutamine 残基的比例很高,似乎比总体结构更加重要,同类结构域间可以互换; ? 富含脯氨酸结构域: 谷氨酰胺结构域类似, 有一个能够激活转录的连续脯氨酸残基的存在 (AP-2, c-Jun,Oct-2) 转录调控的靶标: ? 染色质的结构; ? 通过专一性的TAFIIs 与转录因子 TFIID 相互作用; ? 与转录因子 TFIIB相互作用; ? 通过相互作用或调节TFIIH 复合体的活性而导致RNA聚合酶II的CTD的磷酸化 激素调控:类固醇激素受体 Thanks ! * * 转录因子(TF): 对于转录是必须的,但不是RNA聚合酶的亚基。 (1) 基本转录因子:能够和RNA聚合酶形成转录起始复合物,决定转录的起始位点。 (2) 上游因子:可以识别转录起始位点前的一致序列,对于基因的转录和表达是必须的; (3) 诱导因子:在特定的时间和组织合成和激活,在特定的时间和组织调控基因的转录 二聚体化结构域: 许多转录因子通常以同源或异源二聚体的形式结合 (regulation) 配体结合结构域: 通过结合辅助的小分子而调节转录因子的活性.类固醇激素受体就是这种结构域类型的典型代表 (regulation) 转录因子的结构域: 激活结构域. DNA结合结构域 螺旋-转角-螺旋结构域 ? 该结构域包含60个aa的同源域,由一段同源序列编码; ? 该结构域的识别位置位于螺旋的大沟中与DNA相互作用DNA 例如: λ噬菌体 Cro阻遏物, lac 和 trp阻遏物, cAMP 受体蛋白 锌指结构域: C2H2 锌指: 具有一个12个aa的环,通过两个cysteine 和 两个 histidine残基锚定, 这种锌指折叠形成一个紧密的结构,由两条β链和一个α螺旋组成, α螺旋结合到DNA的大沟中 (9 copies in TFIIIA, 3 copies in SP1) C4 锌指: 锌离子与4个cysteine残基结合,出现在多种类固醇激素受体转录因子中 ,这些转录因子由同型或异形的二聚体组成(two C4 ). 锌指结构域以两种形式存在: 锌指结构模式图: 亮氨酸拉链: 肽链上每隔七个残基就会有一个疏水的leucine 残基,这些残基位于DNA结合结构域的C端α螺旋上. 有规则的leucine残基的重复,使每两圈就有一个亮氨酸出现,在α螺旋的一侧形成了一个疏水的表面, α螺旋疏水表面间可以相互作用,形成二聚体。 碱性结构域: 在许多DNA结合蛋白中发现了碱性结构域,通常与亮氨酸拉链或HLH基序中的一个联系在一起的,因而称为碱性亮氨酸拉链(bZIP)或碱性HLH蛋白 (bZIP transcription factor contains Leu zipper ) . 螺旋-环-螺旋结构域 (HLH) 类似于亮氨酸拉链,只是它的两个α螺旋被一个非螺旋的多肽环分成两个单体蛋白,C端α螺旋一侧的疏水残基可以二聚化. 这种结构在MyoD (肌原决定蛋白)这类蛋白家族中发现过. 转录的阻遏有可能通过直接或间接地对激活因子的干扰而实现 阻抑物结构域: 竞争DNA的结合位点 掩盖了激 活结构域 非DNA结合复合体的形成 直接与通用转录因子的相互作用 *
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