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一种用于工艺研究的混合模型的应用
王金辉
一种基于QbD/PAT思想的
工艺开发混合模型
目 录
文献来源
关键概念
QbD: quality by design(质量源于设计)
PAT: Process Analytical Technology(过程分析技术)
DoE: design of experiments(试验设计)
Neural networks:神经网络
Hybrid model:混合模型
Dynamic modeling:动态建模
背景介绍
FDA推荐使用PAT实现在线检测以及从中间产品到最终产品的闭环控制。
QbD是进行产品开发和工艺改进的一个工具,它基于对产品的深刻理解。哪些工艺参数为CPPs,哪些质量属性为CQAs,参数与参数之间是什么关系,参数与质量之间又有什么关系。参数的范围是多大,为什么要这么大的范围。以上这些问题都可以通过DoE来解决。
通常使用的DoE方法如RSM设计(曲面设计)等,其结果分析为纯数据统计。本论文研究另一种可替代的方法,半参数混合模型,其可将已知的知识与数据统计相结合,我们将使用此模型研究大肠杆菌的培养及其产物重组蛋白生产,并使用QbD和PAT进行评估。
实验方法
一 发酵
1. 以下条件完全一致
发酵罐(4个)、通气率、接种浓度、压力、培养体积、溶氧(调节搅拌速度)。
2. 发酵共分为三个阶段:培养阶段、流加培养阶段、IPTG诱导产品表达阶段。
3. 温度通过夹套控制,pH值通过补碱调节
4. 培养阶段:当pH值开始升高搅拌速度降低时表示C源耗尽,培养阶段结束,流加培养阶段开始。
一 发酵
5. 流加培养阶段:流加培养通过重量进行控制,一直到此阶段,4个发酵罐的所有培养条件均完全一致。
6. 诱导阶段:重组蛋白表达发生在IPTG诱导之后(即第三阶段)。诱导表达的最佳条件通过DoE设计进行确认,因素有温度、pH值、加料速度、生物浓度。
7. 试验在四个不同的发酵罐内进行,培养时间从22-30h不等,但是取样时间均在22h进行,也是DoE试验的终点。
实验方法
二 检测
1. 采用在线监测的方法检测 温度、pH、溶氧、搅拌速度、通气速度、罐压等,15s采集一次数据
2. 为提高计算效率,混合模型采用30min一次的数据进行计算。
3.生物浓度、代谢产物、产品分别采用光密度(OD)、SDS、RP-HPLC等方法进行检测。手动取样。
实验方法
三 工艺开发-DoE
1. DoE 1 :a four-factor Doehlert design (DoE 1 in Table 1,23个试验)
DoE1结果显示,最优工艺参数在所选择水平之外,因此进行第二第三次的DoE
2. DoE 2 :降低温度和生物浓度
因素
生物浓度
温度
pH
加料速度
水平数
5
7
5
3
因素
温度
加料速度
水平数
5
3
实验方法
三 工艺开发-DoE
3. DoE 3 :升高pH值和加料速度
4. 然而通过以上三个试验并没有让产品产率产生明显的提高
因素
pH
加料速度
水平数
3
5
实验方法
三 工艺开发-混合工艺模型(基于理想化模型)
1.
2.
3.
4.
5.
X代表生物浓度,D代表稀释速率
补料速率
P/X代表单位生产率,VP/X产生速率
产品动态产率
补料与生物浓度关系
实验方法
三 工艺开发-混合工艺模型
6. 以上公式描述了碱的补加与生物浓度和产品产率等的关系,这些是不能进行直接检测的,其为以下模型的一部分。
7. 神经网络:对于非线性函数,使用人工神经网络架构是比较合适的,即动态串联混合建模结构。
8. 本模型近似于三层神经网络结构,输入输出层之间的节点具有线性关系,而隐含层为切向双曲传递函数。即:
(w1,w2为网络节点的连接权重,b1,b2为偏差,x1为输入矢量)
实验方法
建模数据库
实验方法
实验方法
建模数据库
实验方法
建模数据库
实验方法
建模数据库
三 工艺开发-混合工艺模型
9. 参数辨识(训练)
c为模型最小加权残差,cexp为试验数据点,分子为试验结果的方差。
使用了梯度下降最小值算法 lsqnonlin (Matlab Toolbox工具),因为采用的是梯度下降法,所以辨识结果能很精确地逼近真实数据。
实验方法
实验方法
参数识别点汇总
检测值和预测值有很好的重合性,碱的消耗可以作为细胞生长与重组蛋白产生的动态指标。
模型结果与讨论
检测值和预测值细胞浓度较好重合,而重组蛋白重合性不好,可能与醋酸的干预有关系。
模型结果与讨论
醋酸、搅拌、碱是影响试验结果的显著因素,然而三者均无法独自作为模型的因素进行输入
模型结果与讨论
工艺结果与讨论
最佳参数位于DOE范围之外,混合模型方法可以预测结果而DOE不可以
工艺结果与讨论
由F图可知,随着细胞质内物
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