蛋白质的三维结构授课版.pptVIP

* * * * * * * * * * * * * * * * * * 蛋白质变性后的理化性质变化： 生物学活性丧失；溶解度降低，易形成沉淀析出；分子形状改变，肽链松散，反应基团增加，易被蛋白酶水解等。 蛋白质变性的可逆性：如果不过于剧 烈，分子结构内部变化尚不大，可复性；若变性程度大，则变性不可逆，不可复性。 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 球状蛋白有各种三级结构 一些小球状蛋白的三维结构图 不同球状蛋白中α螺旋和β折叠构象的比例不同 球状蛋白共同的重要特征：折叠紧凑；疏水氨基酸侧链朝内、亲水侧链位于表面；通过多个氢键和一些离子键来稳定 2.2 球状蛋白的共同结构形式 超二级结构 supersecondary structure ，也叫基序 motif 或简称折叠 fold ：是几个二级结构及其连接的特别稳定的排列。有时候一个大的基序可以组成整个蛋白质，如：α角蛋白的卷曲螺旋。 结构域 domain ：残基数量超过几百个氨基酸的多肽经常折叠成两个或更多稳定的球状单元。 肌钙蛋白C多肽的结构域 几种简单的基序 小的结构基序可以组成大的结构基序 丙酮酸激酶的结构域 蛋白质基序是蛋白质结构分类的基础 具有重要的一级序列相似性，或（和）显示出结构功能相似性的蛋白质，属于同一个蛋白质家族（family） 一级序列几乎没有相似性的两个或更多家族有时也使用相同的主要结构基序，并具有功能上的相似性，这些家族属于超家族（superfamily） 基序基础上的蛋白质分类系统（SCOP数据库） 基序基础上的蛋白质分类系统（SCOP数据库） 基序基础上的蛋白质分类系统（SCOP数据库） 基序基础上的蛋白质分类系统（SCOP数据库） 2.3 蛋白质的四级结构－从简单的二聚体到大的复合体 脱氧血红蛋白的四级结构 脊髓灰质炎病毒壳体蛋白聚合体 烟草花叶病毒壳体蛋白聚合体 形成蛋白质一级结构的化学键是共价键,包括肽键和二硫键.而维持蛋白质空间构象 高级结构 稳定性的化学键是次级键,次级键是非共价键.属于次级键的有:氢键、盐键、疏水键 疏水力 、范德华力等. 蛋白质分子结构与功能的关系 蛋白质一级结构与功能的关系 蛋白质构象与功能的关系 别构现象:蛋白质的构象并不是固定不变的，当有些蛋白质表现其生物学活性时，其构象发生改变，从而改变了整个分子的性质. 模拟的肽链折叠途径 多肽链按步骤迅速折叠 错误折叠引起的死亡：朊病毒疾病 某种错误折叠蛋白质可能是哺乳动物中一些罕见的退化性脑疾的病因。代表有：疯牛病Creutzfeldt-Jakob（克亚氏病）、羊scrapie病（瘙痒病）等。这些疾病有时也称为海绵状脑炎，因为染病的脑常因为空洞化而变得混乱。左图显示的是克亚氏病病人脑皮层染色切片，神经组织学特征表现为海绵（空泡）状退化。 某些蛋白质的折叠在其他蛋白质的辅助下进行 分子伴侣（molecular chaperone）：与部分折叠或不正确折叠的多肽链相互作用的蛋白质，能够加速正确折叠的进行或提供折叠发生所需的微环境。 目前研究得最为详细的两类分子伴侣蛋白：Hsp70蛋白质家族和陪伴蛋白（chaperonin） 蛋白质折叠中的分子伴侣 蛋白质折叠中的陪伴蛋白 蛋白质折叠中的陪伴蛋白 三、蛋白质的变性和折叠 变性（denaturation）：不同的细胞环境引起蛋白质结构或大或小的变化，导致蛋白质功能丧失的三维结构破坏的现象 复性（renaturation）：某些经热、极端pH或变性剂变性的蛋白质，若恢复其天然构象稳定存在的条件，将再次获得它们的天然构象和生物活性，这个过程称为复性。 蛋白质变性 非折叠的、变性的核糖核酸酶的复性过程 变性蛋白质的主要标志：生物学功能的丧失 引起蛋白质变性的因素：化学因素有强酸碱、高浓度尿素或胍、去污剂、重金属盐、TCA、磷钨酸、苦味酸、有机溶剂（如乙醇等）。物理因素有加热、剧烈震荡或搅拌、紫外线及X射线、超声波等。但不同蛋白质对不同因素的敏感度不同。 蛋白质的高级结构 一种球状蛋白－胰凝乳蛋白酶的结构 一个甘氨酸分子 刚性的肽键平面 由于共振和不可旋转，每个肽键都有部分双键性质 一、蛋白质的二级结构 1. α-螺旋模型 左右手螺旋 L-型或D-型氨基酸都可以形成α-螺旋，但所有的组成残基都必须是一种立体异构体，一个D-型氨基酸的出现将打断L-氨基酸组成的规则结构。天然发生的L-氨基酸可以形成右手或左手α-螺旋，但没有在蛋白质中发现左手螺旋。 影响α-螺旋稳定性的因素 连续的有带电R基团的氨基酸残基间的静电排斥或吸引作用 相邻R基团的体积（空间位阻） 相隔3个（或4个）氨基酸残基侧链间的相互作用（氢键） 脯氨酸和甘氨酸残基的存在影响 螺旋片段两端氨