MiRanda Java Interface v10的使用方法.pptVIP

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2016-10-07 发布于重庆
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MiRanda Java Interface v10的使用方法.ppt

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MiRanda Java Interface v10的使用方法

MiRanda Java Interface v1.0的使用方法首先我們先到/miranda_new.html，這一個網站，去下載MiRanda Java Interface v1.0 下載下來會得到這樣一個物件，再將這一個物件解壓縮，就可以得到這一些資料夾，打開bin的資料夾接下來說明有關設定我們先用下載時就有的範例，來示範。 * * 按這裡便可以下載（你的電腦必須有支援JAVA）按下它 Load miRNA sequence是用來讀取miRNA的序列檔案。 Load UTR sequence是用來讀取與miRNA序列比對的序列。 Save Output是用來儲存比對後的結果。 Copy是將選取的文字複製下來。 Select All是將複製所有得文字。 Clear 是指將所有結果全部清除。 Properties是來設定比對的條件。 Score Threshold是用來設定分數的門檻值。 Energy Threshold是用來設定能量的門檻值。 Sacling Factor是指輸出的結果與實際上結果的差距不會超過所設定的比率。首先，先載入miRNA的序列。再載入想要與miRNA比對的序列。 *