蛋白质蛋白质相互作用第二章重点.ppt

生物信息学数据库及其信息检索 生物信息学数据库的种类 核酸、蛋白序列数据库 基因组数据库 生物大分子三维结构数据库 以上述数据库及文献为基础的二次数据库 生物信息学数据库资源 核酸序列数据库 内容包括世界上所有已公布的核酸序列及其翻译产物序列报告和相关注释 GenBank 美国基因数据银行 / Embl 欧洲分子生物实验室 http://www.ebi.ac.uk/embl.html DDBJ 日本国立遗传研究所核酸数据库 http://www.ddbj.nig.ac.jp 蛋白质序列数据库 SWISS-PROT （瑞士日内瓦大学）蛋白质序列数据库 http://www.Expasy.ch NCBI 蛋白质数据库 /entrez PIR 蛋白质序列信息资源库（美、德） 内容包括序列及功能信息、蛋白识别、蛋白质结构预测及其他功能 NCBI 数据库 NCBI(美国国家生物信息中心)成立于1988年，是NIH（国家卫生研究院）的附属机构。 主要任务： 建立公共数据库 (GenBank, dbSNP, OMIM 等.) 开展计算生物学方面的研究 开发序列分析的软件工具 传播生物医学信息 网址： 在NCBI 数据库中查询序列 集成检索系统： Entrez系统 在NCBI中进行序列相似性比对 序列相似性与功能相