高中生物《蛋白质的结构与功能》文字素材7 中图版必修1.docVIP

蛋白质的结构与功能 蛋白质是行使生命功能和构成生命体结构的基本组成物质。蛋白质的组成是由许多不同的氨基酸相互连接并形成各种不同的特殊结构组装而成的。由于氨基酸种类众多，连接方法多种多样，因此蛋白质的种类非常多。不同的蛋白质结构可以行使不同的生物学功能。每一种蛋白质分子都有自己特有的氨基酸的组成和排列顺序，由这种氨基酸排列顺序决定它的特定的空间结构，这就是荣获诺贝尔奖的著名的Anfinsen原理。蛋白质分子只有处于它自己特定的三维空间结构情况下，才能获得它特定的生物活性；三维空间结构稍有破坏，就很可能会导致蛋白质生物活性的降低甚至丧失。 ? ? 1．蛋白质的四个级别的结构 ? ? 目前，蛋白质的结构主要分为四级，一级结构也就是构成多钛的氨基酸排列的顺序，当蛋白质肽链中氨基酸排列顺序相似时，其基本功能相似。特定的氨基酸顺序对于他的功能有重要作用，例如，催产素和抗利尿激素的一级结构很相似，都是八肽，其中有两个氨基酸不同，因此两者的生理作用有较大差异。 ? ? 二级结构是指多肽链主链沿一定方向折叠盘绕，通过氢键作用形成的空间构象，其基本类型为α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲 ? ? 。若干二级结构可以以特殊的几何组合出现在蛋白质结构中，这些组合起来的结构单元称作超二级结构或花样。 由不同的二级结构或者超二级结构可以形成一定的结构域，而结构域又是组成蛋白质三级结构的基本结构单位。一个蛋白质可以只包含一个结构域也可以由几个结构域组成，故结构域是能够独立折叠为稳定的三级结构的多肽链的一部分或全部。结构域也是功能单位，通常多结构域蛋白质中不同的结构域是与不同的功能相关联的。三级结构的一个特点是，亲水基团位于分子表面，疏水基团位于分子内部，形成疏水核心。 ? ? 蛋白质的四级结构是指几个各具独立三级结构之多肽链的相互结集、以特定的方式接触、排列形成更高层次的大分子蛋白质的空间构象。在蛋白质四级结构中，每个各具独立三级结构的多肽链称为亚基。组成蛋白质的亚基数多为偶数，可以是同种或不同种的亚基，不同种的亚基一般都用α、β命名，酶调节与催化亚基多用R、C表示。在具有四级结构蛋白质分子中，亚基单独存在不具有生物活性，但并不是所有蛋白质分子都具有四级结构的，大多数蛋白质只具三级结构已有生物活性，只有分子量比较大的蛋白质才具有四级结构。 ?? 2．蛋白质的折叠与预测蛋白质空间结构 ?? 2．1 蛋白质折叠 ? ?蛋白质折叠狭义的定义就是研究蛋白质特定三维空间结构形成的规律、稳定性和与其生物活性的关系。蛋白质折叠问题是是生物学中心法则中的一个未解决的问题。疯牛病、老年痴呆症等疾病的发生都于蛋白质折叠发生错误有关。现在发现蛋白质折叠速度从几毫秒到几亿分之秒不等，速度是非常快的。折叠的种类大约是1000种。 科学家推断，蛋白质折叠过程会有不同的路径，并形成许多不同的中间产物型态以形成最后的相同形状。这个推断已经被美国威兹曼研究院（Weizmann Institute）化学物理系所作的一项新的研究所证明。该机构主持这项研究的Gilad Haran博士利用他们实验室发展出的一项新技术，首度成功的观察到了单一蛋白质折叠的过程。他们用一种细胞膜脂肪酸组成直径只有100奈米的小水泡将蛋白包裹在其中，可以让蛋白质自由的运动，丝毫察觉不到此水泡载体的存在。之后将这些水泡载体附着在玻离片上，以高度聚焦、直径约300奈米的雷射可以进行长时间的观察。研究人员的观察结果显示，蛋白质在折叠过程中相当小心。它在折叠初期会不断的依环境，自身的条件进行判断。（转自中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心? ? 2．2 第二遗传密码和预测蛋白质空间结构 ?? 现在主要关注的问题是一级结构如何决定它的空间结构？一级结构和空间结构是否也像核苷酸通过“三联密码”决定氨基酸顺序那样有一套密码呢？有人把这设想的一级结构决定空间结构的密码叫作“第二遗传密码”。随着人类基因组计划的完成，由基因推测蛋白质的一级结构的工作变的比较容易了。但是由一级结构推测蛋白质空间结构的工作却非常困难。这主要是由于蛋白质分子结构的极端复杂性决定的。 ? ? 目前结构预测的方法大致可分为两大类。一类是假设蛋白质分子天然构象处于热力学最稳定，能量最低状态，考虑蛋白质分子中所有原子间的相互作用以及蛋白质分子与溶剂之间的相互作用，采用分子力学的能量极小化方法，计算出蛋白质分子的天然空间结构。进年9月16日的science杂志报道了霍化德休斯医学院利用计算机技术对小蛋白的结构进行确定。这个实验采用计算机模拟程序Posetta，目前推测的成功率为33%；第二类方法是找出数据库中已有的蛋白质的空间结构与其一级序列之间的联系总结出一定的规律，逐级从一级序列预测二级结构，再建立可能的三维模型，根据总结出的空间结构与其一级序列之