石榴等观赏植物DFR基因生物信息学分析.docVIP

石榴等观赏植物DFR基因生物信息学分析 　　摘要：根据GenBank 中已登录的红花石榴、粉花石榴、姜荷花、芍药、水母雪莲、大丽花、瓜叶菊和兰花等植物二氢黄酮醇 4-还原酶（DFR）基因的核苷酸序列和氨基酸序列，应用生物信息学软件对其核苷酸序列的外显子、氨基酸序列的理化性质、疏水性/亲水性和跨膜结构等进行了预测。结果表明，这几种植物DFR基因均存在1个外显子，含量最丰富的氨基酸是Ala、Gly、Cys和Thr；除红花石榴和粉花石榴DFR属于不稳定蛋白外，其余植物均属于稳定蛋白。这几种植物DFR蛋白均为亲水性蛋白，存在明显的疏水区和亲水区以及跨膜结构等。 　　关键词：石榴；二氢黄酮醇 4-还原酶（DFR）；生物信息学；理化性质；跨膜结构 　　中图分类号：Q811.4文献标识号：A文章编号：1001-4942（2013）04-0008-04 　　基于生物学试验数据，由分子生物学和信息科学技术相结合的生物信息学已成为后基因组时代用于揭示和探索生命奥秘的重要方法[8，9]。本研究采用生物信息学的方法，以石榴为重点，对红花石榴、粉花石榴、姜荷花、芍药、水母雪莲、大丽花、瓜叶菊和兰花等植物DFR核苷酸及相应氨基酸序列的外显子、理化特性、亲水性/疏水性和跨膜结构等进行预测和推断，以期为深入开展二氢黄酮醇4-还原酶的酶学特性、花色素苷生物合成的分子机制等提供理论依据。 　　1材料