芯片基因组技术突变分析和微生物检测中的应用.docVIP

14 芯片基因组技术在突变分析和微生物检测中的应用 周集中 Dorothae K.Thompson 张晓君译 朱晨光初校，张晓君校 14.1 前言 DNA和寡核苷酸芯片为复杂核酸的检测提供了强有力的工具。芯片应用的两个主要方面是基因表达谱（例如，DeRisi等，1997；Wodicka等，1997）和遗传突变分析（Hacia，1999）。芯片基因表达谱产生整个基因组的数据，这在十年前是不可能的。以芯片进行遗传突变分析仍处于完善阶段，因此还没有很多文献报道。尽管还有很多困难，在遗传突变中，单核苷酸多态性（SNP）最适合于做芯片的靶（Broude等，2001）。而用芯片技术分析多点突变、插入、缺失和重排时遇到很大问题。 最近，芯片基因组技术已被扩展到检测自然环境中的微生物（见Zhou和Thompson，2002；Zhou，2003的综述）。尽管DNA芯片技术已在纯培养物的基因表达分析中得到成功的应用，但它在复杂环境样品中的应用还没有被深入地测试和评价。理论上，芯片基因组技术具有对复杂环境样品进行全面的定量化描述的优势。然而，改进的芯片杂交用于环境研究仍在专一性、灵敏度和定量化方面面临挑战（Zhou和Thompson，2002；Zhou，2003）。 本章简述芯片技术的原理以及芯片技术分析遗传突变和检测自然环境中的微生物的最新进展。介绍了以芯片分析突变的各种方法，并描述了各类可