生化·第1章·蛋白质分解.ppt

绪 论 生物化学（biochemistry）是研究生物体内化学分子与化学反应的基础生命科学，从分子水平探讨生命现象的本质。 　　 第一节 生物化学发展简史 　　1．18世纪中至20世纪初——静态阶段 　　近代生物化学的研究始于18世纪。18世纪的主要发现是生物体的气体交换作用和对一些有机化合物（如甘油、柠檬酸、苹果酸、乳酸和尿酸等）的揭示。 　　19世纪的主要贡献是对人体化学组成的认识和某些代谢过程的发现。这一时期结晶了血红蛋白，提纯了麦芽糖酶，发现了细胞色素，从无机物合成出尿素，从肝中分离出糖原并证明它可转化为血糖等。19世纪末，酶独立催化作用的发现打开了通向现代生物化学的大门。 1990年开始的人类基因组计划（human genome project, HGP）已完成了对人类基因组的测序工作。这一工程的完成标志人类生命科学的发展进入了一个新的纪元，为人类破解生命之迷奠定了坚实的基础。继之而来的后基因组计划，包括蛋白质组计划，将在更加贴近生命本质的更深层次上更加深入地探讨与发现生命活动的规律，以及重要生理与病理现象的本质。 一、 组成单位——氨基酸★★ 组成人体蛋白质的氨基酸有20种，除甘氨酸外，其余的19种氨基酸均为L-α-氨基酸。它们只是侧链R不同。 （二） 氨 基 酸 分 类★ 构成蛋白质的氨基酸有20种，但蛋白质组成中会含有20种以外的氨基酸，如胱氨酸，有些氨基酸是被修饰过的：羟化、甲基化、磷酸化等 人体内还存在一些游离的氨基酸，它们不参与蛋白质的组成，如瓜氨酸、鸟氨酸等，它们主要参与某些物质的代谢 构成蛋白质的氨基酸有20种，但蛋白质组成中会含有20种以外的氨基酸，如胱氨酸，有些氨基酸是被修饰过的：羟化、甲基化、磷酸化等 人体内还存在一些游离的氨基酸，它们不参与蛋白质的组成，如瓜氨酸、鸟氨酸等，它们主要参与某些物质的代谢 阳离子 兼性离子 阴离子 (zwitterion) pH＜pI pH ＝ pI pH ＞ pI 二、肽(peptide) ★★ 肽键 （二）生物活性肽 谷胱甘肽G-SH GSH主要作用：还原剂，抗氧化，保护含巯基的蛋白质不被氧化剂破坏 2GSH 第二节 蛋白质的分子结构★★ 二、蛋白质的二级结构 （一）肽单元 　 O ‖ Cα1—C—N—Cα2 ∣ H 肽 键 平 面 构成蛋白质主链空间构象的基本单位是肽单元或称肽键平面。依靠键的旋转角度不同，肽单元形成的常见构象有：α螺旋、β折叠、β转角和无规卷曲4种，而维系这些结构的化学键是氢键（一个肽键的N-H和另一个肽键的羰基氧形成的氢键）。 无规卷曲是指除上述三种外的一些似乎无确定规律可循的折叠方式。 在这里我们要强调的是蛋白质的二级结构是多肽链局部主链原子的空间分布，不涉及侧链，且一个蛋白质分子中即可以仅出现其中的一种二级结构，也可以出现多种，而且有时它们之间也可以形成一些特殊的结构： （五）模体 ( motif) 许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个具有特殊功能的二级结构组合，被称为模体或模序或超二级结构。例：αα、βαβ、ββ、锌指结构等 三、三级结构（tertiary structure） （一）定义：指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。 第三节 蛋白质结构与功能的关系 一级结构是空间结构和功能的基础 空间结构是其功能的结构基础 当第一分子O2与Hb的第一个亚基（通常为α亚基）结合时，Fe与O2形成第6个配位键，这样Fe的自旋速率加快，Fe的半径缩小并落入卟啉环内 血红蛋白的氧饱和曲线为S形曲线,显示在氧分压低时很难结合O2，随着氧分压的升高，结合O2的能力急剧上升，形成S形的曲线。 这种一个亚基与配体（例如O2）结合后，能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结