分子进化与系统发育学资料.ppt

基于16S/18S核糖体RNA序列比对得到的古细菌系统发育树 （Ettema等，2005） 生命三界： 细菌（Eubacteria） 古细菌（Archaebacteria） 真核（Eukaryotes） （Woese and Fox, 1977） / 1 May 2003/Page 7/10.1126/science.1085952 STORY 4: 电子显微镜下的SARS冠状病毒 100nm a b c d a b c d 拓扑结构： 有根树：反映时间顺序 无根树：反映距离 理论上，一个DNA序列在物种形成或基因复制时，分裂成两个子序列，因此系统发育树一般是二歧的。 一般考虑二歧的树结构：二歧树 分支： 内部分支 外部分支 节点： 内部节点 外部节点 系统发育树的种类 ——有根树、无根树 a b c d a b c d a b c d a d b c b a c d c a b d d a b c a c b d b c a d c b a d d b a c a d b c b a a c c d a b d c a b 考虑4个分类群时，共有15种可能的有根树 a b c d a c b d a d b c 考虑4个分类群时，共有3种可能的无根树 考察类群数为 m ( m ? 3 )的系统树，其可能的拓扑结构数目为： 有根树 无