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关于piRNA及其研究的特点: 相比于miRNA只有500左右的基因位点编码,piRNA的数量有近100000个。 piRNA的来源还没有确定(是直接转录,还是从初始转录本切割而来?)。核算内切酶Zucchini可能与piRNA 5’端的形成有关。 piRNA诱导的沉默复合体靶向RNA的机制还不清楚。 PIWI-piRNA复合体通过序列特异性调节后生过程的机制尚不清楚。 Introduction The Piwi-piRNA pathway in epigenetic regulation Piwi-piRNA在不同有机体中表现出对基因表达的多种调节功能。 在细胞核中,PIWI-piRNA复合体可以调节HP1,H3K9的甲基化,以及DNA的甲基化来影响某些蛋白编码基因,印记基因位点或者转座子的转录。 在胞浆中, PIWI-piRNA复合体可以抑制nuage中的转座子,与Hsp90-HOP作用影响发育稳态,或与转录起始子(eIF)作用,抑制多聚核糖体及蛋白表达。 Piwi-piRNA途径调节后生过程的机制主要为组蛋白修饰和DNA的甲基化。 组蛋白修饰是表观遗传信息从父代遗传到子代的一个主要方法。果蝇实验表明,Piwi蛋白直接影响piRNA靶向位点的组蛋白修饰(与HP1a和H3K9的甲基化功能相关)。 HP1a和H3K9me是染色质转录沉默的标志。 Piwi,HP1和H3K9me之间的分子链从果蝇到秀丽线虫之间是进化保守的。 Piwi在秀丽线虫中的直系同源蛋白PRG-1,通过影响H3K9me,HP1和组蛋白甲基转移酶引起跨代基因沉默。机制尚不清楚。 The Piwi-piRNA pathway in epigenetic regulation DNA甲基化是另一个Piwi相关的表观遗传沉默的标志。 piRNA既能调节转座子基因位点的DNA甲基化,也能调节非转座子位点的DNA甲基化。 尽管其机制尚不清楚,但是这种功能,其高度进化保守的性质说明它非常重要。 The Piwi-piRNA pathway in epigenetic regulation Canalization(进化稳态)是指一种缓冲基因型和环境因素对表型影响的分子机制,来保证发育的稳定性。 一些分子被鉴定与canalization相关,如:Hsp90. 研究证明小RNA也参与canalization。 近期研究将Piwi-piRNA途径与canalization联系起来:Hsp90和Hop通过Piwi-piRNA途径调节catalization。此外Hsp90还通过该途径影响转座子抑制。 The Piwi-piRNA pathway in canalization 研究表明Piwi-piRNAs可影响生殖细胞外的组织,但是除了piwi与piRNA突变表现为不育外,没有其他致命的影响。不排除它对遗传组稳定性和机体健康的长期影响,以及对超过生存需求的功能的影响。 piRNA介导了胚胎在建立后部Nanos梯度中,Nanos mRNA的脱腺苷和降解,这在早期胚胎发育中建立前后轴非常重要。 Piwi-piRNA复合物可以与CCR4-Smg复合物配合介导除Nanos外的基因靶点的翻译调控。 The Piwi-piRNA pathway in post-transcriptional and somatic regulation 有证据表明果蝇的眼中的piwi突变其功能产生影响。另外,piRNA还可以影响海兔神经元中CREB2的表达来介导长期记忆的形成。 piRNA可以调控CREB2启动子的DNA甲基化。 在海马神经元以及其他哺乳动物细胞组织中发现类pi-RNA,具有一般piRNA的一些特征。这些类piRNA在体细胞中比piRNA在生殖细胞中低10-100倍。 The Piwi-piRNA pathway in post-transcriptional and somatic regulation 过去几年中关于piRNA的研究主要集中在:Piwi-piRNA途径对表观遗传和转录后基因调控的调节,对体细胞功能的影响,对发育稳态的影响。 Piwi-piRNA复合物的作用主要通过piRNA的特异性介导,而由于piRNA的多样性,其可能发挥对整个基因组范围的基因调控以及多水平的调控。 今后面临的一些问题: Piwi-piRNA复合物如何在生殖细胞外的体细胞发挥功能; Piwi-piRNA复合物如何实现表观遗传编程;蛋白质如何与不同的piRNA相互作用,调节基因表达。 Concluding remark and future directions The Piwi-piRNA pathway in post-transcriptional and somatic regulation 非编
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