基因组和医学应用要点分析.doc

基因组分析和医学应用 第一节 基因组学基础 人类基因组 人类基因组特点 基因（Gene） 是遗传的物质基础，是DNA或RNA分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列的总称，是控制遗传性状的基本遗传单位。1909年丹麦学者WL.约翰森提出了基因这一名词。 基因组（Genome）泛指一个生命有机体、病毒或细胞器的全部遗传物质；在真核生物，基因组是指一套染色体（单倍体）DNA。基因组(genomes)一词是1920年Winkles从GENes和chromosOMEs组成的。 基因组学（Genomics）是研究基因组结构和功能的科学。具体指发展和应用DNA制图、测序新技术以及计算机程序，分析生命体（包括人类）全部基因组结构和功能。1986年美国科学家Thomas Roderick提出了基因组学(Genomics) 人类基因组特点 人类基因组单倍体约含有3(109个碱基对。 由线性DNA与蛋白质组成染色体结构。 含有大量重复顺序。基因组中大约只有2%-5%为编码序列，约含3万个基因。 单拷贝基因（占基因组50-80%）多数只在分化细胞中翻译为专一蛋白质，如胰岛素基因在胰岛(细胞表达。因为这些基因只在极少数细胞甚至只在生物发育的某个阶段才表达，所以它们在基因组上所占的份额只需单拷贝即能满足生理需要。 多拷贝基因（约1/3 ）是一些与生物的基本功能密切相关的基因，如组蛋白基因、tRNA基因等，只有多拷贝才能满足生理需要。 基因家园 基因组结构复杂，有多个复制原点，但每个复制子的 长度较小。 基因是不连续的。 转录单位一般是单顺反子。即一个基因一种mRNA一种蛋白质，但蛋白质的最终产物可因剪接方式的不同而有差异（如Bcl-x： Bcl-x1；Bcl-xs ）。 存在重复序列。 KpnⅠ家族：人和灵长类DNA经KpnⅠ酶解后，产生4个片段(1.2, 1.5, 1.8, 1.9kb)，被命名为KpnⅠ家族。人类基因组中KpnⅠ序列约在3-6%，散在分布。Alu家族：有3万个成员，平均每6kb就有一个，长度约300bp，因在170bp处有一AluⅠ位点（AG/CT）而得名，具有种的特异性。 存在多基因家族（multigene family）：亦称基因家族，是指一组具有类似功能，核苷酸序列又有同源性的基因。 存在超基因家族（supergene family）：由多基因家族及单基因组成的更大的基因家族。成员间有不同程度的同源，但功能并不相似。如Ig超家族。 基因组学分类 结构基因组学（structural genomics）：通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。 功能基因组学（functional genomics）：利用结构基因组学提供的信息，进行基因和非基因序列功能的研究。 比较基因组学（comparative genomics）：比较不同生物间基因和基因组结构的差异，以增进对基因功能的了解、阐明物种进化关系。 第二节 人类基因组计划 人类基因组计划（human genome project, HGP） 一项多国合作的国际研究计划，旨在阐明人类基因组DNA 3×109bp的序列，发掘所有人类基因，确定其在染色体上的位置，从而破译人类的全部遗传信息。HGP还对包括大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇、拟南芥和小鼠等在内的一系列模式生物体基因组的测序。 人类基因组计划目的 阐明人类基因组30亿个碱基对的序列，发现所有人类基因，并搞清其在染色体上的位置; 破译人类全部遗传信息，使人类第一次在分子水平上全面地认识自我; 解码生命、了解生命的起源、了解生命体生长发育的规律; 认识种属之间和个体之间存在差异的起因、认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象、为疾病的诊治提供科学依据。 人类基因组计划的历程 人类基因组计划的任务 1）人类基因组的基因图构建与序列分析 （遗传图谱、 物理图谱、序列图谱、基因图谱） 2）人类基因的鉴定 3）基因组研究技术的建立 4）人类基因组研究的模式生物（细菌、酵母菌、线虫、果蝇、小鼠、拟南介）的基因组 5）生物信息学的建立 6）有关的伦理、法律和社会问题研究 HGP研究成果与医学 1. 人类基因组约有3.1Gbp，约有30000多个基因，目前已经发现和定位了26000多个功能基因，，其中尚有42%的基因尚不知道功能。基因数量比预期少很多。 2. 人与人之间基因组99.99%是相同的，差异仅万分之一，不存在优秀基因组之说。不存在白种人基因组、黄种人基因组。 3.发现了大约一百四十万个单核苷酸多态性SNP，并进行了精确的定位，初步确定了30多种致病基因 4. 人类基因组中存在“热