5.计算机辅助药物分子设计-a案例.ppt

计算机辅助药物分子设计 计算机辅助分子设计是以计算机作为操作界面和辅助手段，利用计算化学、分子模拟和数理统计方法，构建具有预期药理活性的分子结构 计算方法：分子力学、分子动力学和量子化学计算方法 分子图形显示：三维结构 计算机辅助药物分子设计 基于小分子结构的分子设计---间接方法 二维定量构效关系 三维定量构效关系 基于药效团的分子设计 基于大分子结构的分子设计---直接方法 数据库搜寻分子设计 全新分子设计 间接设计法和直接设计法 间接设计法：是从研究一系列药物分子对同一受体的活性出发，比较它们的结构变化与生物活性之间的关系，找到对该受体能发生结合并产生活性的最普遍的结构因素，在计算机辅助下，设计新的活性分子。 直接设计法：根据受体三维结构设计药物分子，将生物大分子的三维结构（X-线晶体衍射、二维核磁共振或同源蛋白构建法）在计算机上模拟再现，设计是以互补性为设计为依据的。 二维定量构效关系(2D-QSAR) Quantitative Structure-Activity Relationship Hansch-藤田分析：用于先导物优化 物理化学参数表征化合物的整体性质和基团的电性、立体性和疏水性 作用机理相同 化合物骨架相同 用统计学方法筛选和确定参数及其权重 揭示作用机理预测未知化合物的活性 三维定量构效关