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生物计算整体解决方案.ppt
* 下一阶段将进行系统优化 * 一句话简介分布式计算与Hadoop * 并行计算(Parallel Computing)是指同时使用多种计算资源解决计算问题的过程,是提高计算机系统计算速度和处理能力的一种有效手段。它的基本思想是用多个处理器来协 同求解同一问题,即将被求解的问题分解成若干个部分,各部分均由一个独立的处理机来并行计算。 * CAMP Box天合应用服务器出厂预装了PowerDirector虚拟化管理平台,能够帮助用户在10分钟内完成Power虚拟化环境部署及虚拟机的交付,并且能够有效降低用户操作与维护的难度,实现闪电交付。 PowerDirector是IBM? PowerLinux系列服务器内嵌的的虚拟化管理工具,能够提供易用便捷高效的虚拟化管理。可以帮助您只通过Web Browser即可对多台服务器进行分区和虚拟化资源的简化配置管理,特别适用于拥有Power主机环境的中小型用户。 PowerDirector涵盖了虚拟化管理的主流功能,可以管理分区和虚拟资源,并整合多种高级功能以及操作规范,可进行系统资源和虚拟化资源的统一配置和管理工作。而PowerDirector可安装在VIOS中而不影响虚拟化。它主要运行在VIOS内部,实现对服务器的管理功能。PowerDirector主要包含五大类功能:虚拟机管理、镜像管理、性能监控、卷管理及其他支撑功能。 通过PowerDirector可以将一台或多台IBM? PowerLinux服务器的资源进行统一发现、识别、监控、管理,对任意受管的IBM? PowerLinux主机进行LPAR、DLPAR、Micro-Partitioning的创建、修改、管理、迁移和回收,配合用户权限管理、预置/订制模版等功能,可为IBM? PowerLinux服务器的用户环境提供简易、快速、安全和规范的全新操作体验。 * 生物计算整体解决方案 Total Solution of Bio-Computing 张鑫磊 博士 生物信息部 经理 北京健数通科技有限公司 大数据时代的生命科学产业 生命科学机构云体系 DNAdaptor在蛋白质组学研究中的应用 天合生物计算一体机 生物的复杂性决定了生物学大数据的必然性 Short of prior knowledge and hypothesis; even you have it, usually, you are wrong. 数据驱动的科研模式 多组学大数据 全景图 建立假设 试错模式 定义的更好的 新的假设 由点及面:生命科学研究将面对海量的数据 从科研到医学应用—无创DNA产前检测 200,000×150bp Sequence Alignment 大数据时代的生命科学产业 生命科学机构云体系 总体架构 生物计算整体解决方案 DNAdaptor在蛋白质组学研究中的应用 天合生物计算一体机 生命科学机构云 生物计算整体解决方案 DNAdaptor 数据库系统 案例:病原体系统医学资源库 大数据时代的生命科学产业 生命科学机构云体系 DNAdaptor在蛋白质组学研究中的应用 天合生物计算一体机 项目背景与客户需求 作为人类蛋白质组计划(HPP)的重要组成部分,国际染色体蛋白质组计划(C-HPP)于2011年由 HUPO启动。C-HPP计划旨在识别每条人类染色体上基因编码的所有蛋白质,同时获取它们相关的丰度、组织表达特异性、亚细胞定位、翻译后修饰和相互作用组等信息。C-HPP组织采用了“chromosome-by-chromosome”的研究策略,人类24条染色体和线粒体的研究任务分别由全球25个研究团队承担。C-HPP计划的实施产生了大量蛋白质组学数据。 如何从这些不同来源、类型和置信度的海量数据中挖掘生物学知识是亟待解决的问题。一个整合不同数据分析工具、满足科研人员订制化研究需求、且具有良好交互性的软件平台是不可或缺的。? 产品设计 CAPER 2.0: An Interactive, Configurable, and Extensible Workflow-Based Platform to Analyze Data Sets from the Chromosome-centric Human Proteome Project 大数据时代的生命科学产业 生命科学机构云体系 DNAdaptor在蛋白质组学研究中的应用 天合生物计算一体机 根据用户需求选择硬件配置 Hadoop与Symphony Hadoop是一个分布式系统基础架构,由Apache基金会开发。用户可以在不了解分布式底层细节的情况下,开发分布式程序。充分利用集群的威力进行高速运算和存储。 IBM Platform Symphony包含了兼容 Apache
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