实验七分子系统发育案例.pptVIP

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  • 2016-11-22 发布于湖北
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* * 2)序列导入MEGA 5 首先打开MEGA 5软件,界面如下: * * * * * * * * * * * * 野鸽 蝙蝠 大鼠 野猪 牛 人 马 * * * * 作 业 下载核糖核酸酶的蛋白质序列(NP_002924,XP_004054900,Q8SQ12,Q8SQ08,Q8SQ06,P61821,NP_001038203, XP_003901552, NP_001009108, Q8SQ05)存为RNASE1.txt 用写字板整理这些序列,整理为Clustal软件的输入文件。 用ClustalX对核糖核酸酶Rnase进行多序列比对分析(序列文件RNASE1.txt ),将比对结果(.aln文件)以Word文档保存,并存成.fasta文件。用框图圈出该序列中的保守位点,找出3个易变位点。 * 利用MEGA5,对以上序列进行系统发育分析,利用NJ方法构建系统发育树,Bootstrap检验循环次数设为500,将建好的树图编辑,写出每个分支的序列属于哪个物种,翻译出物种名称,并分析哪些物种的核糖核酸酶亲缘关系较近,建好的树图和分析结果整理到实验报告中上交。 将多序列比对和建好的系统发育树图及分析结果整理到实验报告中上交。 * 实验报告 到网络教学平台-基因与蛋白质组学数据分析B2100029-教学材料-实验课件 下载基因与蛋白质组学数据分析实验报告模版 将上述问题答案

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