第06讲-基于配体的药物设计范例.pptVIP

* * * * * * * * * * B、基于靶点的药效团模型 1．受体结构的输入及活性位点的定义： 2．活性位点扫描和药效特征的产生： 3．药效特征的聚类： 4．药效团的修正以及数据库搜索 * * * * Recognition programs of pharmacophore Receptor (1993) Apex-3D (1993, Accelrys) GASP (1995, Sybyl module) DISCO (1993, Sybyl module) CATALYST (Accelrys) GALAHAD (Sybyl module) DS HipHop DS HypoGen 共同点： 都是间接药物设计方法 基于共同的前提，即所研究的活性化合物与靶点相互作用的活性 部位是一致的 不同点： （1）QSAR所研究的是基于同一骨架的系列化合物，侧重于先导化合物的优化过程 （2）药效团模型则高度概括了不同结构类型的多种化合物，更能体现活性配体分子的抽象特征。 * Pharmacophore model and QSAR * * 四、药效团模型的应用 基于药效团模型设计高活性化合物； 虚拟筛选。 * 应用实例一：HIV-1整合酶抑制剂的改造 HIV-1 整合酶对于 HIV 病毒在人体内存活并形成持续感染起着至关重要的作用。HIV-1 整合