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動物肝脏DNA的制备DNA的Tm值测定
动物肝脏DNA的制备 、DNA的Tm值测定
Ⅰ 动物肝脏DNA的制备
一、目的
1.了解肝脏组织制备核酸DNA的方法;
2.弄清DNA制备的过程中,清除RNA和蛋白质的机理 。
二、原理
根据核糖蛋白(RNP)和脱氧核糖蛋白(DNP)在一定浓度电解溶液中溶解度不同,将二者分离。然后用蛋白质变性沉淀剂去除蛋白,并释放出 DNA ,再利用核酸不溶于乙醇的性质将其析出,达到分离提纯DNA的目的。
在0.14mol/L的氯化钠溶液中,RNP溶解度大,而DNP的溶解度却很小;相反,在1 mol/L的氯化钠溶液中, DNP的溶解度却很大,从而使二者获得了分离。核蛋白分离后可用蛋白质变性沉淀剂(氯仿、异戊醇、十二烷基硫酸钠和热酚)去除蛋白质,释放出的DNA用乙醇沉淀,析出核酸。
动物肝脏中含有核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶,因此在提取核酸时,尽量在低温下操作,并要加柠檬酸钠作为金属离子的络合剂。防止Mg 2+、Fe 2+及Co 2+等激活剂,以便降低核酸酶对核酸的水解作用。
三、操作
1抽提
取新鲜鸡肝2g,用SC液洗去血液,低温剪碎(在预冷的研钵中操作),加入4ml SC缓冲液, 用玻璃匀浆器匀浆,然后离心(4000r/min)10min,倾出上层RNP层溶液 。向下层溶液中再加入4ml SC缓冲液,震荡混匀后再4000r/min离心10分钟。倒掉上层溶液。
2分离
将下层沉淀用10ml SC液冲洗并转入50ml三角锥形瓶中混匀后,加入2ml 5% SDS溶液,混匀,再加入7.5ml 氯仿/异戊醇,边振动边加入1.15gNaCL晶体,充分混匀后振荡30min,然后转入到50ml离心管,于4000r/min离心20min。小心用吸管由上至下吸取上层DNA层溶液于干净小烧杯中。
蛋白质层
蛋白质层
氯仿层
水相
3.提纯
加入2倍DNA溶液体积的95%的乙醇,边加入边用玻璃棒沿同个方向缓慢搅动,当成纤维状DNA全部绕在玻璃棒取出,再用95%乙醇2ml冲洗干净,再用5%氨水将其溶解。并用蒸馏水定容到5ml。即为样品溶液。
待测样品编号,放置在冰箱中。
四、思考题
1、在核酸提取溶液中,当加入一定浓度SDS、异戊醇和氯仿后,得到三层溶液分别含有哪些主要物质,为什么?
2、SC缓冲液的组成分是什么,该溶液在制备核酸时有何作用,能否用磷酸盐缓冲液代替?
3、如何用紫外法判断DNA样品的纯度?
Ⅱ 酵母RNA的提取
一、目的
1.了解用浓盐法提纯RNA的基本原理和方法。
二、原理
酵母中RNA含量可占干重3-10%,DNA含量很少。因此采用酵母作为制备RNA的原材料。
适宜于RNA制备的方法有稀碱法、浓盐法和苯酚法。前者是用1%NaOH溶液,将细胞壁溶解,用酸中和。本实验采用浓盐法提取RNA,其机理是用10%NaCL溶液改变细胞膜的通透性,使核酸从细胞内释放出来,然后升高温度使蛋白质变性,将蛋白质与核酸分离,除去菌体,再调至pH 2.5 (RNA的等电点),使RNA沉淀出来。
三、操作
1、提取
称取干酵母粉2g于50mL三角瓶内。加10% NaCl溶液10mL,搅拌均匀,然后于沸水浴中提取半小时。
2.分离
将上述提取液取出,用自来水冷却,分装在离心管内,以3500r/min离心10min,使提取液与菌体残渣等分离。
3.沉淀RNA
将离心得到的上清液倾于50mL烧杯内,并置于有冰块的250mL烧杯中冷却。待溶液冷至10℃以下时,在搅拌下小心地加入等体积的酸性乙醇,随着酸性乙醇的加入,溶液的pH逐步下降,溶液中白色沉淀也逐渐增加,当 pH=2.5(RNA 等电点)时沉淀量最多(注意严格控制pH值),继续于冰浴中静置10min,使沉淀充分,颗粒变大。
冼涤、溶解
将RNA沉淀液离心(3000r/min)5min,去上清,收集沉淀,加入3mL 0.5mol/L碳酸氢钠溶液溶解沉淀( 用玻捧缓慢搅拌沉淀,以助溶解,如有不溶物则为杂质,再离心去除之)。得到RNA制品溶液,供测定之用。如需要进一步纯化时,可在冷却下,加入两倍冷乙醇进行沉淀。
将沉淀物置10ml量筒里,用少量蒸馏水将沉淀物调成糊状,经充分膨胀后,再加少量蒸馏水稀释,然后用6%氨水调pH至7.0,并暂且定容到5ml,测定稀释50倍后的A260应控制在0.6-1.0之间 ,根据该测定值再次调节待测样品的体积,作为待测样品。
待测样品编号,放置在冰箱中。
管号
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
温度(℃)
37
50
60
70
75
80
85
90
95
100
100-50
100-37
保温15min
A260nm
0.487
0.5
0.504
0.51
0.514
0.544
0.578
0.596
0.612
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