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AutoDock 使用教程翻译版 V1.0By BioMS 小组AutoDock Version 4.2Automated Docking of Flexible Ligands to Flexible ReceptorsGarrett M. Morris, David S. Goodsell, Michael E. Pique, William “Lindy” Lindstrom, Ruth Huey, Stefano Forli, WilliamE. Hart, Scott Halliday, Rik Belew and Arthur J. Olson翻译人员：川大-灰太狼，天理-小新，中大-小肽，大工-阿里巴巴2012-11-20目 录自动对接引言 方法概述 新版更新内容理论基础 自由能函数的概述 使用AutoDock 第一步：准备坐标文件使用 AutoDockTools 生成PDBQT 文件第二步：运行AutoGrid利用 AutoDockTools 创建 grid 参数文件(GPF)第三步：使用AutoDock进行对接在 AutoDockTools 中生成对接参数文件(DPF) 第四步：评价对接结果 对接记录文件中的信息使用 AutoDockTools 分析对接结果附录1：AutoDock 文件格式 PDBQT格式的坐标文件 AutoGrid 格点参数文件：GPF 原子参