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真核生物基因表達的调控81446
课次:19
教学目的:使学生了解真核基因表达调控的特点、转录前的调控,掌握增强子的作用特点和反式作用因子的DNA结合域的结构花式。
重点:增强子和反式作用因子的DNA结合域的结构花式。
难点:反式作用因子的DNA结合域的结构花式。
复习旧课:提问2人,了解教学效果。
导入新课:
第八章 真核生物基因表达的调控
第一节 概述
真核生物细胞中由核膜将核和细胞质分隔开,转录和翻译并不偶联;基困组是由多条染色体组成。
真核基因的调节分为:
真核基因表达调控的特点:
第二节 转录前的调控
一.?? DNA的甲基化与去甲基化
真核DNA中的胞嘧啶约有5%被甲基化为5-甲基胞嘧啶(5-methylcytidine,m5C),而活跃转录的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。
甲基化可使基因失活,去甲基化又可使基因恢复活性。
二 染色质结构对真核基因转录的调控
1.染色质结构影响基因转录
常染色质中的基因可以转录,异染色质(heterochromatin),无基因转录表达。
2. 组蛋白的作用
组蛋白扮演了非特异性阻遏蛋白的作用,
非组蛋白成分起到特异性的去阻遏促转录作用。
核小体结构影响基因转录。
三 基因重排和基因扩增对基因表达的影响
基因重排(gene rearrangement),即原胚性基因组中某些基因会再组合变化形成第二级基因。
基因扩增(gene amplification),即基因组中的特定段落在某些情况下会复制产生许多拷贝。
基因丢失:在细胞分化过程中,丢掉某些基因而去除其活性。例如某些原生动物,线虫、昆虫、甲壳类动物,体细胞常丢掉部分或整条染色体,只保留将来分化产生生殖细胞的那套染色体。例如在蛔虫胚胎发育过程中,有27%DNA丢失。在高等动植物中,尚未发现类似现象。
第三节 真核基因转录水平的调控
1 顺式作用元件 (cis-acting elements)
顺式作用元件:对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因;通常不编码蛋白质,多位于基因旁侧或内含子中。
1.1 启动子
(1) 核心启动子成分,如TATA框;
(2) 上游启动子成分(UPE),如CAAT框,GC框,八聚体(octamer)等;
表 哺乳动物RNA PolⅡ启动子上游转录因子结合的序列元件
?组件
保守顺序
DNA长度
结合因子
大小(Da)
丰度(/细胞)
分布
TATA box
TATAAAA
~10bp
TBP
27,000
?
普遍
CAAT box
GGCCAATCT
~22bp
CTF/NF1
60,000
300,000
普遍
GC box
GGGCGG
~20bp
SP1
165,000
60,000
普遍
Octamer
ATTTGCAT
~20bp
Oct-1
76,000
?
普遍
Octamer
ATTTGCAT
23bp
Oct-2
52,000
?
淋巴细胞
KB
GGGACTTTCC
~10bp
NFKB
44,000
?
淋巴细胞
KB
GGGACTTTCC
~10bp
H2·TH1
?
?
普遍
ATF
GTGACGT
~20bp
ATF
?
?
普遍
1.2 增强子 Enhancer又称远端上游序列(far upstream sequence)。
最早SV40病毒中发现,可使旁侧的基因转录提高100倍。组成:100-200bp,可以单拷贝或多拷贝串连形式存在。 正性调控元件
增强子的作用特点:
① 促进基因的转录效率远距离发挥作用 (100~500bp,10Kb)
② 促进转录,不具有启动子专一性
③ 功能与方向、位置无关
④ 具有组织或细胞特异性
1.3 沉默子 silencer
负性调控元件,与转录因子结合抑制转录。
作用特点:
不受序列方向的影响,
能远距离发挥作用,
并可对异源基因的表达起作用。
2 反式作用因子(trans-acting factors)
反式作用因子:通过扩散自身表达产物(酶、调节蛋白)控制其他基因的表达,其编码基因与其识别或结合的靶序列不在同一个DNA分子上。
转录因子(transcription factor):起正调控作用的反式作用因子。
2.1 TF的分类:
(1)??通用转录因子,在一般细胞中普遍存在,
主要识别一些启动子的核心启动成分TATA框,如TBP;
上游启动子成分CAAT框,如CTF/NF-1;
GC框如SP1;
识别八聚体核苷酸的Oct-1等;
(2) 特异转录因子:特殊组织与细胞中的,如淋巴细胞中的Oct-2 ;
(3) 诱导型因子:和特异调控序列结合。
2.2 TF结构特征
DNA结合域,binding domain,BD:100aa, 大沟
转录激活域,active domain,
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