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- 2016-11-28 发布于重庆
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數据挖掘在植物蛋白质组学研究中的应用
数据挖掘在植物蛋白质组学研究中的应用
刘欢
(学号:51041300069,导师:张红锋)
摘要:数据挖掘是一个崭新的计算机应用领域,是一种从数据库中提取预测性信息的新技术。本文在介绍植物蛋白质组学研究背景的前提下,阐述了数据挖掘的原理、方法及其在植物蛋白质组学研究中取得的进展,分析了现有数据挖掘技术存在的问题,提出当前应该在确保数据质量的前提下,重视数据挖掘中系统数据分析和归纳的能力。
关键词:蛋白质组;植物蛋白质组学;数据挖掘;数据分析
2000年6月人类基因组工作框架图的完成,标志着生命科学的研究进入了后基因组时代。此时生命科学的研究重心开始从揭示生命的所有遗传信息,逐渐转移到对生命功能的整体性研究上。蛋白质组学这一新兴学科应运而生。蛋白质组学的定义是:“对一个组织、细胞、或亚细胞组分中蛋白质群的系统分析”[1]。在蛋白质组学的研究中,植物蛋白质组学的研究仍处于起步阶段。如何结合生物信息学技术,对植物蛋白质组进行系统、高效的研究,是后基因组时代功能基因组学研究的重点领域。其中特别是如何结合最新的数据挖掘技术,对提取的大量数据进行分析、综合、归纳和判断,以此来发现蛋白质组中隐藏的关系和规则,提出预测性的建议,成为了研究中的热点。
植物蛋白质组学研究的现状
1.1 植物蛋白质组学的概念、意义以及产生背景
蛋白质组(proteome)这一概念,最早由Wilkins等(1994)提出
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