动物肝脏DNA提取和鉴定-实验技术程序.ppt

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核酸含量的测定方法:紫外吸收法、定磷法和分别针对DNA和RNA的颜色反应方法。 脱氧核糖核酸中的脱氧核糖在酸性环境中变成ω-羟基-γ-酮基戊醛与二苯胺试剂一起加热产生蓝色化合物,在595nm处有最大的吸收 。 DNA20~400微克范围内,光密度与DNA的浓度成正比,在反应液中加入少量乙醛,可以提高反应的灵敏度。 三、实验试剂 95%冷乙醇、NaCl固体 二苯胺:称取纯二苯胺1g溶于100ml冰醋酸中,加入10ml过氯酸,混匀。临用时加1ml1.6%乙醛溶液,所配置试剂应为无色。 0.14mol/L NaCl-0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液(PH=6.8) DNA标准液200ug/ml:DNA钠盐用5mmol/L的NaOH配制。 氯仿/异戊醇=20:1(V/V) 5% SDS 组织捣碎匀浆机 猪肝8g 匀 浆 16ml的0.14mol/L NaCl-0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液 离心,4000r/min ,10min 上清(弃掉) 沉淀 沉淀 25ml缓冲液洗涤 离心,4000r/min ,20min 上清(弃掉) 40ml的0.14mol/L NaCl-0.05mol/L 柠檬酸钠缓冲液 沉淀 21ml氯仿/异戊醇 4ml 5% SDS 振荡 30 min(保鲜膜封口) 加入3.6gNaCl 固体,终浓度为1mol/L 离心,3500r/min ,20min 吸取上清(量取体积) 95%冷乙醇(缓慢加入)边加边朝一个方向缓慢搅动 DNA粗制品 STAR STAR * * * 动物肝脏DNA的制备和鉴定 甘肃中医药大学 核酸的分类 DNA (脱氧核糖核酸) 主要存在于细胞核的染色体中。 核外也有少量DNA,如线粒体DNA(mtDNA),叶绿体DNA(cpDNA),质粒DNA。 RNA(核糖核酸) 存在于细胞质中,如mRNA, rRNA, tRNA等。 除上述DNA,RNA外,还有非细胞形式存在的病毒和噬菌体,其或只含DNA,或只含有RNA。 核酸的理化性质 在细胞内通常与蛋白质结合,以复合物形式存在 微溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有机溶剂 在酸性溶液中容易降解,在中性或弱碱性溶液中较稳定。 DNA溶液粘度很大,RNA的粘度较小 在强大离心力的作用下,可以从溶液中沉降下来 浓盐法:利用RNA和DNA在不同盐浓度溶液中的溶解度不同将二者分离。 离子去污剂法:利用SDS、CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)等去污剂使蛋白质变性,直接从生物材料中提取DNA。 苯酚抽提法:苯酚既是蛋白变性剂,又能抑制DNase的降解。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA连接键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。 基因组DNA的提取方法 核酸制备中常用的去垢剂 核酸本身带负电荷,结合带正电荷的蛋白质。用于核酸提取的去垢剂,一般都是阴离子去垢剂。 去垢剂的作用: 1.溶解膜蛋白及脂肪,使细胞膜破裂; 2.溶解核糖体上面的蛋白质,使其解聚,将核酸释放出来; 3.对RNase、DNase有一定的抑制作用。 如:SDS、脱氧胆酸钠、4-氨基水杨酸钠、萘-1.5-二磺酸钠、三异丙基萘磺酸钠 作用: 1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除去,以防造成蛋白污染。 2.某些蛋白质变性剂也有抑制 RNase活性和破裂细胞的作用。 如:苯酚、氯仿、盐酸胍、DEPC 核酸制备中常用的蛋白质变性剂 核酸制备中常用的酶 DNase:降解DNA RNase:降解RNA 蛋白酶K:降解蛋白质 溶菌酶:破碎细胞 核酸提取的主要步骤 沉淀核酸,去除盐类,有机溶剂等杂质 除去与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂类等生物大分子:酚/氯仿抽提、蛋白变性剂(SDS、异硫氰酸胍等)、蛋白酶处理、高盐洗涤 除去其它不需要的核酸分子 破碎细胞:研磨、组织匀浆、超声、冻融;异硫氰酸胍、碱裂解;酶解(溶菌酶) 注意事项 加入RNA降解酶除RNA 加入DNA酶抑制剂:柠檬酸、氰化物、砷酸盐、EDTA、SDS、苯酚等 蛋白变性剂反应不宜过于剧烈 避免过酸、过碱及高温 一、实验目的: 1、学习并掌握用浓盐法从动物组织中的提取DNA方法及其原理。 2、学习和掌握二苯胺法测定DNA的原理和方法。 二、实验原理 核酸在真核细胞中都是以与蛋白质结合的状态存在,用DNP和RNP表示。 DNA-Pro(DNP) 细胞核 RNA-Pro(RNP)

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