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- 2016-12-01 发布于天津
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蛋白质组分析数据库InterPro和CluSTr在全基因组蛋白.doc
021402122 王峰 生物技术2002
蛋白质组分析数据库: InterPro 和 CluSTr在在线全基因组蛋白质功能分类上的应用
Rolf Apweiler*, Margaret Biswas, Wolfgang Fleischmann, Alexander Kanapin,
Youla Karavidopoulou, Paul Kersey, Evgenia V. Kriventseva, Virginie Mittard,
Nicola Mulder, Isabelle Phan and Evgeni Zdobnov
EMBL Outstation, The European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge,
CB10 1SD, UK
摘要:EBI的SWISS-PROT小组已经发展一个蛋白质分析数据库,这个数据库能够利用现有的资源对细菌、真核生物的全基因组中预言的编码序列进行对比分析。作为现在使用两个主要的方案,InterPro和CluSTr给出了关于蛋白家族、域和位点的新看法并且覆盖了31-67%(interPro的统计数据)的每个全基因组的蛋白质。CluSTr覆盖了3个真核生物的全基因组和人类基因组的一部分。伴随着基因组分析数据库的还
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