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科研数据处理004_生存分析
科研数据处理004生存分析制作人:张浩然邮箱:haorantongxie@163.com本讲的相关配置操作系统和配色方案:WIN7 Home Basic屏幕分辨率:1024×768数据处理软件Microsoft Office Excel 2010IBM SPSS Statistics 19GraphPad Prism 5Origin 8.5.1问题1:临床研究的生存分析研究眼部按摩疗法是否有助于视力的恢复。实验记录的结果是康复所需的天数。这种台阶图怎么画?两组是否有显著性差异?问题2:动物试验的生存分析荷瘤小鼠接受不同的药物处理,通过比较裸鼠存活的天数,来判断药物是否有效。请绘制生存曲线(如右侧台阶图)A和Control是否有显著性差异?A和B是否有显著性差异?相关关键词生存分析(Survival Analysis)生存函数Kaplan-Meier生存曲线(Survival Curve)注意和“生长曲线growth curve”区分多重比较(Multiple Comparisons)计划比较(Planned Comparisons)大家可以在百度、Google上搜索以上关键词。生存分析可使用的软件GraphPadOriginSPSS科研数据处理004_生存分析一、生存分析——2个实验组【原始数据】生存分析(2组)对照组治疗组受试者编号康复需天数受试者编号康复需天数1两年未康复11632两年未康复1296371713189429314217543215209放弃治疗658716369764017123人间蒸发839118542968819499用眼药水10两年未康复20258目的:研究眼按摩疗法是否有助于视力的恢复。方法:挑选20个视力为4.6的受试者分成两组——对照组和治疗组,记录视力恢复到5.0的所需的天数。该研究期限为2年。【目标图片和目的】生存分析(2组)生存分析(2组)的组间比较GraphPad提供两种比较方法:Log-Rank法Gehan法默认使用第一个。除非有充足理由才使用第二个。若P值≤0.05,则两组的生存曲线存在显著性差异。科研数据处理004_生存分析二、生存分析——3个实验组【原始数据】生存分析(3组)生理盐水组测试药物A市售药物B裸鼠编号存活天数裸鼠编号存活天数裸鼠编号存活天数11792417282211028注射失败183531911401926423122520425231325213963114382245725越狱受存活81916332441【实验方法简述】:给裸鼠接种肿瘤,以肿瘤体积达到某预定值的时间定为0天。按组别注射生理盐水或药物,记录裸鼠的存活天数和肿瘤体积变化。实验观察的期限为50天。【目标图片和目的】生存分析(3组)生存分析(3组)的计划比较3个实验组的生存分析的P值≤0.05,只能说明3组内存在显著性差异(通俗的说就是,三组治疗不完全等效)。取计划进行两两比较的两组,重新进行2个实验组的生存分析。将计算出来的p值与0.05进行比较。多重比较和计划比较Multiple Comparisons:控制总体的最大试验误差率为0.05,对Comparisons使用校正过的α(比0.05要小)。Planned Comparisons:控制Comparisons的误差率为0.05,相对更容易捕捉微弱信号,但容易放大总体试验误差率。科研中多为探索性实验,总体的结论有时不太有用,多数用Planned Comparisons。科研数据处理004_生存分析三、生存分析——4个实验组以上【原始数据】生存分析(4组)生理盐水组测试药物A市售药物B联合给药A+B裸鼠编号存活天数裸鼠编号存活天数裸鼠编号存活天数裸鼠编号存活天数117924172825392211028注射失败18352638319114019262742423122520422849523132521392950仍存活631143822453050仍存活725越狱受存活3143819163324413247【目标图片和目的】生存分析(4组)没有显著性差异怎么办?探索性实验有时不必拘泥于统计学的条条框框。Choice1:做一个遵守统计学规律的好孩子,忽略微弱信号。Choice2:冲破这些死板的规律,捕捉到这些微弱信号,继续用实验证明。科研数据处理004_生存分析四、生存分析拓展知识生存分析在不同软件的输入方式SPSS和OriginGraphPadTimeGroup1Group2Group3105112111330145114211431198010111261TimeStatusGroup105111211113301145121421214312198031011312613GraphPad是通过不同列来分
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