基于序列特征的固有无序蛋白结合位点的统计分析
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(物理与电子信息学院,山东德州253023)
摘 要关键词 ; 序列分析1引言
1.1固有无序蛋白质
蛋白质是构成生物体最重要的两类大分子之一,蛋白质翻译在整个生物过程中发挥着非常重要的作用。传统思想认为,蛋白质要实现生物功能,必须先折叠成一个稳定的三维结构,因此形成了蛋白质结构决定其功能的主流观点,对蛋白质科学的研究已经取得了一系列成就,创造了现代蛋白质科学的大爆炸时代[1]。然而,随着基因工程方法和实验技术的发展以及基因组计划的开展,在上个世纪90年代初人们发现有些蛋白质或蛋白质序列中的一部分区域在生理条件下不具有一个确定的三维结构,但依然能够正常行使生物学功能。后来发现,这类蛋白质越来越多,并逐渐形成了一种新的蛋白质类型,称为固有无序蛋白质[2,3,4]intrinsically disordered proteins,简称为IDPs。固有无序蛋白质的特征是整条链或链的一部分并不具有严格的三维结构,原子位置及主链二面角没有特定的平衡值而是随着时间发生很大的变化。经过十多年的研究,人们发现这类蛋白质在生物体内普遍存在而且十分丰富[5,6],可以位于细胞的不同部位。研究还发现,真核生物体中含有的固有无序蛋白质数量远远高于古细菌和细菌中的固有无序蛋白[7,8],即生物进化的一个重要特点是蛋白质中无序区的含量在增加。固
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