3_引物设计及测序结果(2016教案)精讲.ppt

引物设计界面 First you can design the primer manually Sense strand or anti-sense strand Useful information of the primer 引物搜索选项设定 引物类型 搜索模式 5’引物位置范围 3’引物位置范围 产物大小范围 引物长度 搜索结果 28对引物 引物分值 100分为满分 每对引物的信息 双击选中一对引物 引物信息 回到主窗口 引物及产物信息 是否出现hairpin,dimer,false priming and cross dimer 引物编辑 引物分析 首先检查引物二聚体尤其是3’端二聚体形成的可能性。 二项检查是发夹结构(hairpin);与二聚体相同,发夹结构的能值越低越好。 第三项检查为GC 含量,以45-55%为宜。 第四False priming 检查 引物编辑 Edit primer here Analysis the edit result Accept the edit result Return to the main window 二、引物设计提高篇 用绿色荧光蛋白(GFP)标记蛋白NR1 SP pcDNA3.1 NR1 Plasmid 1: Plasmid 2 GFP SP BamHI pcDNA3.1 NR1 Plasmid 1: Plasmid

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