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有机化学实验的经历
(一):从实验记录谈起
我在国内高校研究生院做了三年合成实验,在美国高校研究生院做了五年合成实验,而在药厂又做了三年合成实验。在此把我的经历作个比较,供大家参考。
我那时在国内高校做实验,实验记录本是从仓库领的,和街上买的普通笔记本并无不同。对如何记录实验也并无统一详尽规定,我的记忆中导师只说了一句话,实验要如实记录, 其他的细节就留给我掌握了。但初进美国研究生院时,情景可大不一样,记得专有一英文课,详细讲述做科研的道德规范和作抄袭的种种情况,等到进了科研组,导师郑重其事地亲手交给每个新生一本厚厚手册, 一本他自己当年的实验记录本,和一篇组里前辈论文的支持数据材料,并指着这数据说,...respect these is more important than (respect) me..., 等到进了公司,关于如何记录实验就有更专门的规定,而且每年有小测试,确保每个做实验的人明了各个细节。我现将我导师写的关于实验记录本的部分规定翻译出来,供大家欣赏借鉴。
1。 为何要有notebook?
-原始科学数据 -无二的真相
2。记录实验的原则
-实验记录的目的是为其他的科研人员,不是做实验的本人。
-他人应能凭之重复实验,观测到同样现象,得到同样结果。
3。记录本的组织
-封皮有人名,序列号,研究方向
-有目录/索引
-依次记录,不可移去任一页
-每个实验新起一页,不可空页,跳行记录
-划去每页空白
-页底签名
-记录时直接在本上用黑墨水写,不可涂改,用单化线划去笔误并附脚注
4。记录内容和排版
-有标题和日期
-配平的反应方程式;试剂的用量(质量或体积,如体积标出密度), 摩尔数, 当量数,来源,CAS 号,纯度,物性参数如熔沸点,旋光度等
-注意有效数字
-特殊条件标出如玻璃干燥细节,无氧无水或无光操作等
-所依文献或已做实验
-记录所有相关操作细节 (时间,温度,加料方式等)
-记录所有现象(色,溶, 沉淀,气)等
-复印TLC, GC, HPLC
-记录实验后处理工序(萃取, 洗涤所用容积;干燥剂;蒸馏时间,压力,温度)
-注意检查质衡
-详尽记录纯化步骤 (重结晶,溶剂,体积,温度,是否活性炭处理,收率;蒸馏, 所用玻璃仪器, 真空度,蒸馏头温度,内温,浴温,每个馏分质量;走柱子,溶剂,硅胶量,每级分量和RF值)。
-纯化样计算收率
-纯化样用所在notebook 页数标号;其相应数据如谱图等以此标号注明归档。
-结语,实验结果,解释, 可能改进建议
-附图谱 NMR, IR, MASS, 结构式,谱上注化合物名,人名
-附色谱 GC, HPLC, 柱型,长度, 温度,压力,流量
-对手性化合物,消旋样分离色谱,旋光物分离色谱;测旋光
-签名公正
(二):谈谈如何定量反应
在优化实验时,建立可靠的定量方法至关重要。我把我的体会和大家交流一下,希望能起个抛砖引玉的作用。
称量分离纯化的产物大概是最精确的定量办法了。在读博时,我做的大部分反应是通过这个原始的方法加以优化的。那时对优化的要求不高,往往产率达到70%以上可发论文即交差了,所以同一底物3,4个反应便可搞定,即便以此原始定量方法,苦干五年,也拿了博士学位。再者,导师经费有限,分析设备资源跟不上,而研究生的体力和时间似乎总是可以挤一点,再挤一点, 再挤一点。。。
到了药厂后,每人一台HPLC,有人专门配溶剂,照应设备,其他如GC, IR, RAMAN, NMR, UV-VIS,MASS都随时可用,而对优化的要求是尽最大努力,时限是要最快,所以一定要巧干加苦干才行。我想国内现在LC,GC应用该十分普遍了,就把我这三年工作中学到的如何用LC,GC经验先作交流。
一般来说,我接到优化反应的任务时,第一件工作是写下完整的配平了的反应方程,分析所有可能的副反应,写出所有可能中间体及副产物的结构,这第一步我称之为脑子预热;第二件工作是或买或找备齐这些主产物,中间体,可能的副产物,并建立LC或GC分析方法,因为这要东奔西跑找药品,要动手配溶液,我称之为热身;热脑热身后,最有趣的工作就可开始了,一般说来我的第一轮实验会尽量把这么几个问题的答案拿到:1。产物在反应条件下的稳定性;2。每个反应物在反应条件下的稳定性;3。在极端当量比下的产率。这几个答案是进行下一轮优化的基础,而只要建立了合适的定量和取样方法,这第一轮的工作常常是一天便可完成。
关于作标准曲线,我的经验是用质量浓度(WT%)比用体积浓度(WT/V)精确。我一般会用万分之一天平称3~5份300~500毫克的样品来配标准溶液(
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