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与转录起始和终止有关的DNA结构 第二节 为什么说是与转录起始和终止有关的DNA结构？ 启动子/启动子结构 Pribnow box/Sextama box/CAP 位点 终止子/终止子结构/ρ因子 帽子位点/TATA box /CAAT box /增强子 启动子/转录因子 转录单位起点/转录区/上游（-）/下游（+） 没有编号为 0 的位点 ？转录相关的酶如何与启动子识别 （一）启动子的结构 RNA聚合酶识别DNA上的特殊序列，以合适的构象相互结合，打开DNA链以介入需要转录的碱基部位，然后开始合成RNA。 参与：启动子的碱基序列、RNA聚合酶的σ亚基以及一些辅助蛋白。 过程： ①RNA聚合酶结合到识别位点上 ②移动到起始位点上 ③建立一个开链式启动子复合物 （一）启动子的结构 启动子序列 CAP-cAMP结合位点 RNA酶介入位点 以－10核苷酸序列为中心，由6bp组成共有保守序列TATAAT 。每个碱基出现的频率为T80A95T45A60A50T96（右下角的数字为出现频率） 功能：是RNA聚合酶牢固结合位点，简称结合位点。 使封闭的RNA聚合酶全酶和启动子二元复合物转变成开放的二元复合物（解链，形成转录泡）。 －10序列由A-T碱基对组成，在DNA双螺旋解链时所需要的能量显然低于G-C。 转录起始至延长阶段也是σ因子与RNA聚合酶的结合与解离的循环。起始反应的终止在σ因子的释放。 在起始阶段，全酶与DNA形成稳定复合物，对连接部位一级结构的专一性很强 在延伸阶段，为了能沿模板移动，则必须放松对DNA的结合，因此，转录起始后立即从全酶中释放出σ因子 σ因子的结合保证了原核生物RNA聚合酶只能与启动子区而不是其他区域形成稳定的二元复合物。 σ因子的存在，引导β和β‘的构象有利于与DNA的结合 σ因子不存在，β和β‘的与DNA的结合不专一 在－35序列附近，由6bp组成共有保守序列TTGACA，每个碱基出现的频率是T82T84G78A65C54A45。 功能：是RNA聚合酶依靠其σ因子对转录起始位点的识别，又称识别位点。 RNA聚合酶分子大，覆盖约70bp的DNA序列，转录起始聚合酶先结合－35序列，再结合－10序列。 －10位点和－35位点一起又称作核心启动元件 RNA聚合酶优先识别强启动子，两个序列决定了启动子的强度，因此，细胞可以由此来调节单位时间内所转录的mRNA分子数，从而控制蛋白质的合成速度。 Sextama框的碱基序列在很大程度上决定了启动子的强弱 Pribnow框的碱基序列通过影响开链式启动子复合物的形成速度而控制转录 转录效率主要受两者之间的距离影响，而与两者之间的碱基序列相关不多。两者的距离为17bp时转录效率强。 3.CAP位点 CAP：分解代谢物激活蛋白 CRP：环腺苷酸（ cAMP ）受体蛋白 目前已知激活因子，是一种二聚体蛋白质。该蛋白与cAMP结合后（形成CAP- cAMP复合物 ），刺激RNA聚合酶与起始部位结合，从而起始操纵子转录过程。 cAMP的结合能提高CAP对双链DNA的亲和力。 CAP与启动子结合是激活转录的必要条件。 （二）终止子结构 终止子：提供终止信号的的序列，存在于RNA聚合酶已经转录过的序列中，使RNA聚合酶释放新生的RNA链，并与模板DNA脱离。 不依赖于蛋白辅助因子的终止子： 转录终止点前的回文序列中富含GC碱基对，在回文序列的下游方向含有AT碱基对。 依赖蛋白辅助因子的终止子： 蛋白辅助因子—ρ因子，又称释放因子。 二、真核生物启动子 真核生物3种RNA聚合酶 RNA聚合酶Ⅰ：转录rRNA，只有一种启动子 RNA聚合酶Ⅱ：转录蛋白质基因和部分snRNA基因的转录，启动子结构较复杂 RNA聚合酶Ⅲ：转录tRNA和5sRNA，启动子位于转录的DNA序列之内，为下游启动子。 （一）RNA聚合酶Ⅰ启动子 转录rRNA，只有一种启动子 具有明显的种族特异性，每种生物有其特定的转录因子与聚合酶Ⅰ结合。 近启动子:-40~+5,决定转录起始的精确位置。 远启动子：-165～-40，影响转录的频率。 （二）RNA聚合酶Ⅱ启动子 转录蛋白质基因和部分snRNA基因的转录。 多部位结构，主要有四个部位。 1、帽子位点 转录的起始位点，其碱基大多为A（非模板链）两侧各有若干嘧啶核苷酸。 2、TATA盒 又称Hogness框，－25附近 TATA序列 框的两侧富含GC碱基对的序列，是该框作用的重要因素之一。 功能：决定了转录起始点的选择。 有些真核生物基因的启动子没有TATA盒 原核生物与真核生物的TATA框（盒）差异 ① 位置不同：真核生物的TATA盒位于转录起始部位上游－25bp处，而原核生物位于－10bp处。 ② 原核生物的TA