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用MCEM算法估计多序列有根树最优分支长度 摘要 系统发育树是通过对生物序列的研究来推测物种的进化，其核苷酸替代模型通常假设序列进化为完全数据，但现实中很难满足此假设，针对事实，本文运用MCEM加速算法对序列长度假设不变，但存在缺失情形下做出了Jukes-Cantor模型下含缺损数据的DNA序列构建有根树最佳分支长度的参数估计，并说明了MCEM加速算法比EM算法更有效。 关键词：系统发育树，MCEM加速算法，Jukes-Cantor模型，参数估计. Estimated using the MCEM algorithm sequence with the optimal length of branch root tree （1. Qinghai University，Xining 810016,china；2. Qinghai Normol University，Xining 810008,china） Abstract: Phylogenetic tree is based on the research of the biological sequence to estimate the evolution of species . The nucleotide substitution model usually assumes that the sequence evol