chapter1 蛋白质section 2课件.pptVIP

丝心蛋白(fibroin)：这是蚕丝和蜘蛛丝的一种蛋白质。丝心蛋白具有抗张强度高，质地柔软的特性，但不能拉伸。丝心蛋白是典型的反平行式?-折叠片，多肽链取锯齿状折叠构象。 （三）胶原蛋白 原胶原蛋白分子中的 单链（左手螺旋） 一股原胶原蛋白分子 胶原纤维 原胶原蛋白的头 1000AA （四）弹性蛋白(elastin) ?弹性蛋白是弹性纤维的主要成分；主要存在于脉管壁及肺。 ?弹性纤维与胶原纤维共同存在,分别赋予组织以弹性及抗张性。 ?弹性蛋白是高度疏水的非糖基化蛋白，具有两个明显的特征: ?构象呈无规则卷曲状态; ?通过Lys残基相互交连成网状结构。 Elastin is a polymeric, crosslinked protein that confers elasticity to lung-tissue 五、超二级结构和结构域 1、超二级结构 　　在蛋白质分子中，由若干相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。几种类型的超二级结构：α α(在纤维状蛋白和球状蛋白中异同；七残基重复序列 P220)；ββ；βαβ(大多为右手交叉)；βββ． 　　★超二级结构在结构层次上高于二级结构，但没有聚集成具有功能的结构域． α α ββ βαβ 一些已知功能的超二级结构: 2、结构域 　　　对于较大的蛋白质分子或亚基，多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体缔合而成三级结构。这种相对独立的三维实体形成的三级结构的局部折叠区就称结构域。　 结构域通常是几个超二级结构的组合，是球状蛋白质的独立折叠单位；对于较小的蛋白质分子，结构域与三级结构等同，即这些蛋白为单结构域，如肌红蛋白；较大的蛋白由两个或两个以上的结构域组成。 结构域一般由100~200 个氨基酸残基组成，但大小范围可达 40~400 个残基。氨基酸可以是连续的，也可以是不连续的． 结构域之间常形成裂隙，比较松散，往往是蛋白质优先被水解的部位。酶的活性中心往往位于两个结构域的界面上． 结构域之间由“铰链区”相连，使分子构象有一定的柔性，通过结构域之间的相对运动(别构效应)，使蛋白质分子实现一定的生物功能。 在蛋白质分子内，结构域可作为结构单位进行相对独立的运动，水解出来后仍能维持稳定的结构，甚至保留某些生物活性． ★结构域与功能域的关系： 有时一个结构域就是蛋白质的功能域，但不总是； 功能域包含一个但通常是多个结构域 六．蛋白质的三级结构与球状蛋白质 　　 蛋白质的三级结构是指多肽链在二级结构的基础上进一步盘旋、折叠，从而生成特定的空间结构。包括主链和侧链的所有原子的空间排布。一般非极性侧链埋在分子内部，形成疏水核，极性侧链在分子表面。 球状蛋白质的结构特征： ①含有多种二级结构； ②具有明显的折叠层次； ③为紧密的球状或椭球状实体(有一定的空隙，且较集中于活性部位)； ④疏水R基在分子内部（即疏水作用，为主要折叠动力），亲水R基在分子外部； ⑤表面具有一个结合配体的空穴。 注：一级结构决定高级结构（RNA酶复性实验 P235） A、核糖核酸酶变性与复性作用 Native ribonuclease Denative reduced ribonuclease Native ribonuclease 8 M urea and ?-mercapotoethanol Dialysis 变性 复性 Ribonuclease A: Amino Acid Sequence Ribonuclease A B、二硫桥在稳定蛋白质构象中的作用 RNA酶肽链上的一维信息控制肽链自身折叠成特定的天然构象，并由此确定了Cys残基两两相互接近的正确位置。 二硫桥对肽链的正确折叠并不是必要的，但对稳定折叠结构作出贡献。 蛋白质的三维结构归根到底是由一级序列决定的，三维结构是多肽链上的各个单键旋转自由度受到各种限制的总结果。 这些限制包括：肽链的硬度、肽链中疏水基和亲水基的数目和位置、带正电荷和负电荷的R基的数目和位置以及溶剂和其他溶质等。 七、蛋白质的四级结构 （1）有关四级结构的一些概念 四级结构(quarternary structure)指由相同或不同的称作亚基（subunit）的亚单位按照一定排布方式缔合而成的蛋白质结构。 亚基一般是一条多肽链，有时也称单体。本身具有球状三级结构。 原（聚）体 蛋白质 单体蛋白质 寡聚蛋白质 同多聚 杂多聚 （2）四级结构的内容 蛋白质的四级结构涉及亚基种类和数目以及各亚基或原聚体在整个分子中的空间排布，包括亚基间的接触位点（结构互补）和作用力（主要是非共价相互作用）。对称性是四级结构的重要性质(指亚基缔合)。 （3）在结构与功能上的优势： ① 增强结构的稳定