蛋白质-配基相互作用的鉴定.docVIP

10. 蛋白质－配基相互作用的鉴定 Timothy Palzkill 张晓君、毛跃建、李旻、张晶、赵琴丽、徐灵筠译；申剑初校；张晓君修校 10.1 前言 基因组测序计划已鉴定了大量的以前未知的基因。然而，甚至对于已被深入研究的模式生物，如大肠杆菌和酿酒酵母，大约三分之一的基因的功能仍未知。了解基因组中所有基因的功能的挑战促进了高通量实验技术的发展，并因此推动了大规模描绘蛋白质－蛋白质以及蛋白质－配基的相互作用。 蛋白质－蛋白质相互作用在功能性细胞内扮演着重要的角色。在基因组规模上确定蛋白质的相互作用可建立蛋白质相互作用网络，这种网络可为基因产物的功能提供重要的线索。例如，如果一个未知功能的蛋白可与已知功能的一族蛋白相互作用，说明这个蛋白与它们具有相同的功能（Schwikowski等，2000）。蛋白质－蛋白质相互作用的鉴定可以通过提供它们与复合体的结合模式为生物学过程的机制的了解提供新观点。例如，即使知道一类蛋白参与某个生物学过程，我们也不知道这些蛋白是否或怎样与复合体相互作用以实现它们的功能。蛋白质－蛋白质作用谱图提供了蛋白质相互作用的详细信息因此提供复合体组织的精确信息。 本章综述了在基因组规模上蛋白质相互作用的研究方法。包括如酵母双杂交系统的在体方法和一些体外方法，如质谱、噬菌体展示和蛋白芯片等。 10.2 开放阅读框的高通量克隆 测定基因组规模的蛋白功能的功能基因组