第二章细胞的分子机制.pptVIP

第三节 RNA加工后水平调控 一、差别RNA加工与基因产物的多样性 RNA的加工有多种形式，例如多个可选择的5’转录起始点，多个内含子的可变剪接，可选择性的3‘终止信号及RNA碱基的不同修饰等，其中不同内含子的可变剪接是最常见的加工方式，其产生的不同mRNA的数量也最多。 不同组织中原肌球蛋白基因的可变剪接 （引自Scott F. Gilbert 2006） 果蝇Dscam基因mRNA前体的互斥剪接（自Yang ，2011） 二、选择性RNA加工与性别决定 RNA的可变剪接在果蝇雌雄性别分化和发育中起着十分关键的作用。性致死基因（sex-lethal，sxl）在雄性胚胎的早期并不表达，在雌蝇中最早由PE启动子启动，其产物是一种序列特异性的RNA结合蛋白（Sxl蛋白），随后PE启动子关闭。以后在雌雄蝇中由上游晚期启动子（PL）启动的SX1基因均被激活。但在雌蝇中早期SX1蛋白可指导晚期SX1转录产物的剪接，从而产生有功能的晚期SX1蛋白；在雄蝇中因无早期SX1蛋白，其晚期SX1的转录产物发生组成性剪接产生无功能的晚期SX1蛋白。这是因为在雌果蝇中该基因的第3外显子的5‘端结合了早期SX1蛋白，导致其与内含子一起被剪掉；因该第3外显子中有终止密码，因而雄蝇产生截短无功能多肤（不含RNP结构域），在雌蝇中该基因产物却有功能。 mRNA的寿命与蛋白质的合成 mRNA的结构和翻译效率 翻译后水平的调控 翻译后水平的调控 第五节 表观遗传修饰与细胞分化 一、DNA的甲基化 DNA甲基化的发生 小干扰RNA（siRNA）和长非编码RNA（lineRNA）可通过与基因的启动子序列结合，指导其发生特异性的甲基化，组合组蛋白的修饰而使染色质发生重塑而抑制其表达，但也有少数例证表明有些 lincRNA（l例如HOTTIP)可能通过与其配体蛋白质结合定位在其靶基因区，导致组蛋白H3K4的三甲基化而激活该基因。 DNA的甲基化多发生在胞嗜陡的第5位碱基，在真核生物中十分普遍，也被认为是DNA的“第5种碱基” 。 DNA的甲基化经常出现在3类DNA序列（ CpG,CHG,CHHo ）中。前2种序列为对称甲基化位点,CHH是非对称甲基化位点,CpG经常位于基因启动子附近或者GC岛中 。 哺乳动物中的三种甲基化酶 在哺乳动物中DNA的甲基化是由3种甲酶催化的（Dnmtl，Dnmt3 a和Dnmt3 b）。 Dnmtl对DNA复制后甲基化模式的维持有重要作用，它可对半甲基化的新合成DNA链进行甲基化。Dnmt3 a和Dnmt3 b是与从头甲基化过程有关（de novo methylation )，在这个过程中需要建立新的甲基化模式。Dnmtl和Dnmt3 a均可与组蛋白脱乙酞酶（HDACs）互作，从而抑制基因的表达。 基因表达的激活和抑制 激活：胶质纤维酸性蛋白（GFAP)基因启动子的START3结合位点CpG的脱甲基化可以激活该基因的表达。 抑制：(1)DNA的甲基化也可以通过几种甲基CpG结合蛋白 （MECPs)识别DNA甲基化模式而抑制基因的表达 (2)另一种甲基CpG结合蛋白MBD2与多亚基的NuRD（它们含有依赖ATP的染色体重塑因子Mi-2和HDACs)形成复合物，抑制甲基化的启动子，使染色体发生高效的重塑。 从头甲基化过程 在动物受精后，不论是来源于父系基因组还是母系基因组均发生大规模的脱甲基化（印迹基因除外），然后再重建新的甲基化模式。 有一个模型可能揭示其机制：基因转录起始点结合RNA聚合酶B，募集SET蛋白使覆盖这个区域的核小体组蛋白H3 K4发生甲基化，H3 K4甲基可抑制Dnmt3 L的结合，使从头甲基化酶不能作用这个区域，因而整个基因组中除了结合有RNA聚合酶11的CpG岛外，均可发生从头甲基化过程。 二、组蛋白的修饰与细胞分化 组蛋白八聚体中的4种蛋白N端尾巴有许多氨基酸可被不同的酶所修饰，例如，甲基化（Me）、乙酞化（Ac）和脱乙酞化、磷酸化（P）、泛素化、ADP一核糖基化等，其中发生在精氨酸和赖氨酸的甲基化修饰比较复杂，有单甲基化、双甲基化（对称和不对称）及三甲基化。 组蛋白密码：这些修饰的种类、位置和组合共同决定着核小体的状态，进一步控制基因的转录或者抑制，被称做组蛋白密码（histone code）。 组蛋白修饰的作用 （1） 组蛋白的修饰可以通过改变不同组蛋白之间