高级生化计算.ppt

学习目标与科学能力 已知编码蛋白质的DNA被转录链的碱基序列，能指出信使RNA中相应区域的碱基序列，以及蛋白质中相应的氨基酸序列。对于DNA中一个碱基被另一个碱基置换的突变，能推断出mRNA和蛋白质会如何改变。 已知某一必需营养物的线性代谢途径，对于该途径中任何一种酶有缺陷的突变型菌株，能推断出哪些中间产物可使该缺陷型菌株恢复生长能力。反过来，已知某一线性代谢途径中哪些中间产物可使突变体恢复生长能力的数据，能够推断出在该途径中出现的各种酶和中间产物的顺序。 对于影响某一生物过程的一组突变，已知其所有配对组合是互补还是不互补的数据，能够把这些突变分组，使每一个组与一个不同的基因对应。 学习目标与科学能力 给定双链DNA分子上一种或多种限制酶切割位点的位置，能推导出该DNA产生的片段数目和长度，并能绘图示意电泳后这些片段在凝胶上出现的位置。 已知用数种限制酶分别和以不同组分切割某双链DNA分子所得DNA片段的凝胶图，能推断出显示整个DNA分子的酶切位点位置的限制图。 已知某双链DNA分子的限制图及被某个DNA或RNA探针覆盖的区域，能指出在用任何一种或多种限制酶进行的Southern印迹中，哪个或哪些DNA片段会被标记。 对于已知的DNA序列，能选择可在聚合酶链式反应中扩增该分子的特定片段的引物寡核苷酸序列。 讨论质粒、转座因子和可移动DNA在致病细菌进化中的作用。致病菌通过进化而可以抵抗多种不相关的抗生素，使得对感染的治疗极其困难。 叙述在细菌和噬菌体遗传学研究中常用的方法及主要的突变体种类。 根据野生型等位基因被转导噬菌体共转导的频率，构建细菌突变型等位基因的遗传图。 在Hfr ? F-细菌细胞的中断交配中，已知遗传标记的进入时间，推导每个Hfr株的基因的遗传图及转移的起点和方向。 已知一组Hfr株每一株的遗传图及转移的起点和方向，预测每个遗传标记的进入时间。 图示溶源性噬菌体（如?噬菌体）进行位点特异整合和切除的过程。 能在由3个氨基酸组成的多肽示意图中，指出各个氨基酸，并标出肽键。 能图示转录过程，并能描述细胞怎样决定在何处起始和终止转录。 能画出假想的真核生物初级RNA转录物及其加工过的形式的结构。 能指出真核生物与原核生物在起始翻译上的不同之处。 已知编码氨基酸的DNA序列及转录方向，能推导出RNA转录物序列及多肽链中相应的氨基酸序列。 能描述遗传密码的一般结构及特点。 能指出负转录调节机制和正转录调节机制的差异。 能叙述乳糖操纵子的负调节机制和正调节机制。 能陈述RNA二级结构在弱化子或核糖开关终止转录中的作用。 能解释GAL4、GAL80和GAL3在酵母乳糖基因转录调节中的作用，并能推断不同类型突变体的调节表型。 能描述siRNA和microRNA分子在基因表达调节上的作用。 能给转录调节的“表观遗传”下定义，并指出与表观遗传改变相关的DNA和染色质修饰的主要类型。 能指出特定DNA片段的限制性位点及载体的克隆位点，以便让该片段可以指定方向插入该载体。 能陈述编码蛋白质的基因组区域中的进化签名----近缘物种在DNA序列上的特征性差异。 能理解DNA芯片的原理与应用。 能指出在转基因生物中靶向基因中断和靶向基因置换的区别。 能指出自发突变和诱发突变、种系突变和体细胞突变、条件突变和无条件突变、功能失去突变和功能获得突变的差别。 能解释为什么在密码子第一或第二位的核苷酸置换更有可能导致的是非同义突变而不是同义突变。 能叙述影印培养实验，该实验证明突变的发生与它们对机体是否有利没有关系。 能预测以碱基类似物、X射线或紫外线处理细胞时，可能出现的突变类型。 能指出错配修复和核苷酸切除修复的差别，并能解释为什么错配修复对于DNA复制的准确性更加重要。 能叙述推动细胞进行生长、DNA合成、中心体定位、纺锤体形成及细胞周期其他方面的周期蛋白、周期蛋白依赖性激酶及蛋白质降解的作用。 能指出细胞周期的主要检查点，并能解释检查点障碍怎么会导致突变，染色体异常、不分离及多倍性。 能解释p53蛋白在细胞周期阻滞时让DNA损伤得以修复或促进凋亡的核心作用。 能给肿瘤抑制基因和癌基因下定义，并能分别叙述这两种基因的突变如何能够导致癌症。 能指出白血病发生中启动子融化和基因融合的差异。 l. How Long Is the Ribonuclease Gene? What is the minimum number of nucleotide pairs in the gene for pancreatic ribonuclease (124 amino acids long)? Suggest a reason why the number of nucleotide pairs in the gene might be much large