生物信息学考试重点.docVIP

Made by Kim 2008级基础医学 1 在进行序列局部比对的时候，能不能在同一位置插入双gap？为什么？ 不能，因为如果能在同一位置插入双gap的话，就能在两条序列的任何位置插入双gap，得出的对比结果都是一样的，没有统计学意义。 2 解释生物信息名词BLAST、CDS（GBFF格式中的特性关键词）、NCBI、UPGMA、EBI。 BLAST：Basic Local Alignment Search Tool基本局部相似性对比搜索工具； CDS：Coding sequence蛋白编码区信息； NCBI：National Center of Biotechnology Information 美国国立生物技术信息中心； UPGMA：unweighted pair group method with arithmetic mean 非加权算术平均组对法； EBI：European Bioinformatics Institute欧洲生物信息学中心。 3 NCBI的BLAST工具有5个基本程序，分别为nucleotide blast，protein blast，blastx，tblastn，tblastx，请分别说明每个程序解决的问题。 Blastn:用核酸序列搜索核算数据库； Blastp:用蛋白质序列搜索蛋白质数据库； Blastx