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下呼吸道包括气管、支气管、细支气管、细支气管末端进入肺泡。下呼吸道标本的微生物学检验由于受上呼吸道正常寄生菌群的影响，结果往往难于正确判断，存在各种各样的问题，有必要加以关注。　在健康人群口、鼻咽部寄居的微生物种类繁多(见表1)，可条件致病，引起下呼吸道感染。　表1 在健康人群的口、鼻咽部寄居的微生物　可能的条件致病微生物　少见的条件致病微生物　不动杆菌、绿色链球菌(包括米氏链球菌)、β溶血链球菌、肺炎链球菌、金苗色葡萄球菌、脑膜炎奈瑟菌、支原体、流感嗜血杆菌、副流感嗜血杆菌、卡它莫拉菌(布兰汉)、白色念珠菌、单纯疱疹病毒、肠杆菌科细菌、分枝杆菌、假单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌(假单胞菌)、丝状真菌、臭鼻克雷伯菌、啮蚀艾肯菌、拟杆菌、消化链球菌、放线菌、嗜沫嗜血杆菌、龈内阿米巴、毛滴虫非溶血性链球菌、葡萄球菌、微球菌、棒杆菌、奈瑟菌(除淋病、脑膜炎奈瑟菌)、乳牛杆菌、韦荣球菌、螺旋体、龋齿罗氏菌、口腔纤毛菌、月形单胞菌、粘液性口腔球菌、弯曲菌　细菌致病首先要在呼吸道取得一个立足点，粘附在组织黏膜上，生长繁殖到足够数量才能致病。用避免污染的方法从下呼吸道无菌部位分离到的细菌(见表2)无论数量多少均应报告医生。　表2 呼吸道病原体　肯定的呼吸道病原体少见的呼吸道病原体　白喉棒状杆菌(产毒素)、结核分枝杆菌、肺炎支原体、沙眼衣原体、肺炎衣原体(TWAR)、百日咳鲍特菌、军团菌、卡氏肺囊虫、诺